【摘 要】
：
目的 探讨DNA N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenine,6mA)修饰在低出生体重(Low Birth Weight,LBW)儿脐血全基因组中的分布及差异表达.方法 分别选取4例低出生体重儿作为实验组,4 例正常出生体重儿作为对照组,从脐血样本中提取DNA,采用6mA 免疫沉淀测序法(6mA immunoprecipitation sequencing,6mA-IP-seq)进行测序,
【机 构】
：
广东省职业病防治院,广东省职业病防治重点实验室,广东,广州510300;广州医科大学公共卫生学院,广东,广州511436
【出 处】
：
中国毒理学会表观遗传毒理专业委员会第一次学术大会
论文部分内容阅读
目的 探讨DNA N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenine,6mA)修饰在低出生体重(Low Birth Weight,LBW)儿脐血全基因组中的分布及差异表达.方法 分别选取4例低出生体重儿作为实验组,4 例正常出生体重儿作为对照组,从脐血样本中提取DNA,采用6mA 免疫沉淀测序法(6mA immunoprecipitation sequencing,6mA-IP-seq)进行测序,并进行生物信息学分析,研究6mA 位点修饰的差异.根据KEGG 信号通路富集结果,筛选启动子区富集程度显著的基因,对候选基因运用6mA-IP-qPCR 技术进行定量甲基化分析验证.结果 差异峰关联基因分析显示,与对照组相比,低出生体重儿组6mA 修饰显著上调差异峰关联基因有4657 个,主要分布在增强子、上游、启动子区以及转录因子结合位点；6mA 修饰显著下调差异峰关联基因有4840 个,主要分布于基因间区和内含子区.两组图谱均显示,DNA 6mA 甲基化修饰广泛分布于新生儿脐血基因组中,线粒体基因组、19 号染色体中的6mA 密度明显高于常染色体；DNA 6mA 修饰水平在转录起始位点(TSSs)和转录终止位点(TESs)上较低,在TSSs 上游2000bp和基因区域较高.差异峰关联基序分析结果显示,实验组中AAGGAAGG、ACGTRB为主要特征基序.GO 富集分析提示基因体区6mA 甲基化水平差异基因主要与神经系统发育、离子通道活性、细胞内信号转导等功能相关；启动子区6mA 甲基化水平上调基因主要与干细胞分裂与增殖、磷脂酶活性、转录因子结合等功能相关,下调基因主要与cAMP 细胞免疫应答、共转运体活性等功能相关.KEGG 富集分析提示基因体区6mA甲基化水平上调基因参与通路有48 个,显著富集在吗啡成瘾通路,下调基因参与通路有50 个,显著富集在谷氨酸能突触通路；启动子区6mA 甲基化水平上调基因参与通路有18 个,显著富集在醚脂质代谢、甘油磷脂代谢等通路,下调基因参与通路有3 个,显著富集在氮素代谢通路.功能富集分析结果提示低出生体重儿6mA 基因与胚胎生长发育密切相关.6mA-IP-qPCR 实验结果显示参与醚脂质代谢途径的磷脂酶家族基因PLD2、PLA2G4C、PLA2G6 的6mA 修饰水平显著上调(P＜0.05).结论 DNA 6mA修饰可能参与了胚胎生长发育过程的调控.
其他文献
目的 微囊藻毒素-LR(microcystin-LR,MC-LR)是一种由蓝藻产生的新兴环境污染物,具有很强的生殖毒性.我们过去的研究显示MC-LR 可以诱导中国仓鼠卵巢细胞自噬并伴有细胞内钙水平的升高.Ca2+/钙调蛋白依赖性蛋白激酶β(CaMKKβ)被认为是调控自噬的关键因素.因此,本研究旨在探索CaMKKβ通路在微囊藻毒素-LR 诱导KK-1细胞(来源于小鼠卵巢颗粒细胞)自噬中的作用.方法
目的 探究草铵膦父系暴露对子代神经行为发育的影响并阐明其毒作用机制,旨在为预防草铵膦的错用滥用和保障后代健康提供科学依据.方法 将8 周龄近交系C57BL/6J 雄性小鼠随机分成正常饮水组、草铵膦染毒组.依据人群ADI×安全系数,将染毒剂量设置为0.2mg/kg/day,连续染毒10 周(两个生精周期),评价两组雄鼠的生育能力.然后,按雌雄2∶1 合笼交配产仔,同时,为了排除雌雄交配行为差异和精浆
目的：流行病学调查提示成年骨关节炎的发生具有胎儿发育起源.我们前期证实孕期咖啡因暴露(prenatal caffeine exposure,PCE)可引起子代大鼠软骨分化不良及成年骨关节炎易感.近期有研究发现,软骨局部胆汁酸代谢异常与成年骨关节炎的发生相关.然而,PCE 所致的胎源性成年骨关节炎的易感是否与局部胆汁酸代谢异常有关尚不清楚.方法：Wistar 大鼠于孕第9-20 天给予生理盐水或咖啡
目的 探讨组蛋白的泛素化和乙酰化修饰在亚砷酸钠(NaAsO2)慢性暴露所致雄性生殖障碍中的作用,为发现砷化物所致雄性生殖障碍的生物学机制及寻找新的早期生物学标志提供科学线索。方法 雄性C57BL/6J 小鼠(6～8 周)自由饮用含0、5、10 和20 ppm NaAsO2 的饮水6个月后,与正常雌性小鼠进行交配,观察怀孕情况；记录其子代的数量及窝重；记录雄性小鼠的睾丸大小及睾丸指数；取小鼠精子,利
目的：本研究旨在探讨有机磷农药(Organophosphate pesticides,OPs)、拟除虫菊酯类农药(Pyrethroid pesticides,PYRs)复合暴露对2 岁幼儿神经行为发育的影响,并探索胎盘表观遗传学改变是否在其中发挥作用。方法：基于莱州湾出生队列(Laizhou Wan Birth Cohort,LWBC),将完成孕晚期农药暴露水平测定的379 名孕妇及子代纳入本研究
目的 探讨微囊藻毒素-LR(microcystin-LR,MC-LR)能否激活睾丸特异性长非编码RNA-THOR(LncRNA-THOR),触发RAS 调节胰岛素样生长因子2(IGF2)下游信号通路,进而激活丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路,诱导c-fos、c-myc 等原癌基因的高表达,对生殖系统造成损害,完善MC-LR 对男性生殖系统的毒性作用及其分子机制.方法 本研究以0、1、5、10
目的：流行病学研究表明成年肾小球硬化的发生具有宫内起源.本研究验证了孕期地塞米松暴露(prenatal dexamethasone exposure,PDE)所致雌性子代宫内肾脏发育不良和成年肾小球硬化的多代遗传效应,并探究其潜在的宫内编程机制.方法：Wistar 雌性大鼠自然受孕,于孕9～20 天皮下注射生理盐水或地塞米松(0.2mg/kg.d).部分孕鼠于GD 20 经麻醉处死,取胎鼠肾脏待检
环境中的镉污染问题再次成为江西省乃至全国公共卫生关注的热点,镉是公认的内分泌干扰物,镉能够通过引发女性的性激素分泌紊乱,从而造成对女性健康的多种损害。女性体内雄激素的增多能够导致女性不孕,甚至有男性化的表现,同时也会导致内分泌失调,引发痤疮、多毛等症状,甚至引起多囊卵巢综合症、肥胖等疾病。但通过之前的研究认为镉可能并不是通过影响经典的雌激素受体(ER)通路或者调整雌激素相关基因,进而影响性激素的分
目的：本研究旨在通过整体、细胞和分子实验研究孕期地塞米松暴露(PDE)所致雄性子代足细胞发育毒性的miR-135a 编程机制.方法：Wistar 雌性大鼠自然受孕,分为正常对照组和PDE 组.PDE 组于孕9～20 天皮下注射0.2mg/kg.d 地塞米松,对照组给予等容量生理盐水.孕20 天处死部分母鼠,取雄性胎鼠肾脏待检.其余孕鼠自然分娩,雄性子代正常饲养至出生后6 周(PW6)或PW28 处
目的：探讨miRNA 表达谱改变在纳米二氧化硅的雄性方法：本研究采用小鼠GC-2spd 生精细胞作为研究模型,分别采用0、0.05、0.5、5μg/mL纳米二氧化硅对GC-2spd 细胞进行连续30 代染毒.并将染毒30 代的对照组和5μg/mL组进行miRNA 表达谱和mRNA 表达谱的检测,并通过目标miRNAs 的抑制剂和mimics对5μg/mL 纳米二氧化硅染毒30 代的生精细胞进行转染