缘毛类纤毛虫系统发育基因组学研究

来源 :中国动物学会原生动物学分会第十八次学术讨论会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shayneinfo
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缘毛类纤毛虫(Peritrich)是最早发现的原生动物,已有三百多年研究历史,传统分类学研究将缘毛类纤毛虫划分为固着类(Sessilida)和游走类(Mobilida)两个类群,但是近年来根据SSU rDNA进行的系统发育研究显示固着类与游走类并未聚为一支,所以缘毛类纤毛虫的系统发育关系仍有待厘清.我们对采自武汉、广东的湖泊及水产养殖基地的5科8属10种缘毛类纤毛虫,包括累枝虫(Epistylis)、聚钟虫(Campanella)、聚缩虫(Zoothamnium)、独缩虫(Carchesium)、钟虫(Vorticella)、盖虫(Opercularia)共6属7种固着类,车轮虫(Trichodina)、小车轮虫(Trichodinella)共2属3种游走类,进行了转录组测序.目前,基于系统发育基因组学的方法,从25个纤毛虫组学数据中获得120个直系同源基因共45,669个氨基酸位点用于分析缘毛类纤毛虫的系统发育关系.结果显示:固着类与游走类聚为一支,说明缘毛类纤毛虫是单系的;且结合螅状独缩虫(Carchesium polypinum)柄蛋白质组和不同发育时期转录组信息探讨了固着类各类群间的系统发育关系.
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