对东方巴贝斯虫(Babesia orientalis)的线粒体基因进行克隆和测序及序列拼接，通过与牛巴贝斯虫线粒体基因的比对获得东方巴贝斯虫细胞色素b基因，并以此为基础构建东方巴贝斯虫细胞色素b的系统发育树。应用EST序列分析结果和电子克隆结果，采用PCR技术，扩增东方巴贝斯虫线粒体基因，将获得的序列与pMD18-T载体相连接，测序后将各个片段利用clustalx软件进行拼接，并结合牛巴贝斯虫线粒体基因进行同源性比对，获得东方巴贝斯虫细胞色素b基因并进一步构建了细胞色素b(cytochromeb，Cytb)基因的系统发育树。结果表明：东方巴贝斯虫线粒体基因与牛巴贝斯虫线粒体基因的同源性高达87％，细胞色素b基因的同源性也达到了89％;根据系统发育树的结果，显示东方巴贝斯虫属于小巴贝斯虫种，与吉氏巴贝斯虫的亲缘关系最为相近。最后鉴定所获得的序列即为东方巴贝斯虫线粒体基因和细胞色素b基因，大小分别为5157bp和714bp。