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现代分子生物学研究越来越呈现出高通量、规模化特点,使得计算机程序辅助研究成为必不可少的手段。以字符串操作、处理见长的Perl语言在现代分子生物学研究中得到越来越广泛的应用。本文就perl在DNA、蛋白质等生物大分子序列数据批量获取、截取、查询、命名、格式转换以及序列比对、分子标记电泳带谱数字化转换等方面的应用情况进行概述。