作为我国科技创新的“试验田”,科技企业孵化器主要为尚未成型的中小高新技术企业提供实体空间、基础设施、技术咨询和投资融资等服务,从而降低创业风险,提高企业创新能力,促进企业成长,以创业刺激就业,推动区域经济发展水平提升以及经济结构的转型。本文运用三阶段超效率DEA模型对2016-2020年我国25个省份科技企业孵化器的运行效率进行实证分析,通过传统DEA模型和三阶段超效率DEA模型结果对比,分析了科技企业孵化器运行效率,同时使用SFA效率前沿方法对影响2020年我国25个省份科技企业孵化器的环境因素进行研究分析。运用Malmquist指数模型分析了 2016-2020年我国25个省份科技企业孵化器运行的动态规律,利用GM（1,1）模型对我国科技企业孵化器的人力、物力等资源需求进行了预测,分析其未来发展动向。基于现状和未来发展情况对我国科技企业孵化器的科技资源配置提出有针对性的建议,对促进其优化科技资源配置具有一定参考意义。研究结果表明:（1）我国科技企业孵化器运行效率总体情况良好。科技企业孵化器运行的综合效率值为DEA有效的省份虽在个别年份有减少,但是总体上呈现增加的趋势,而其运行的综合效率平均值表现为出先减小后增加的态势。通过对我国科技企业孵化器运行效率研究发现,各省份科技孵化器资源的投入量与其科技企业孵化器规模报酬之间有某种程度的约束关系,而非单纯的投入要素数量越多,所产出的经济效益或者社会价值就越大。总体来看我国科技企业孵化器运行效率区域间差异化明显,呈现出东部运行效率高,西部运行效率较低,中部地区处于中间水平的特点。Malmquist指数计算结果显示,各省份的科技企业孵化器运行效率呈现出不同的增长特征。在此期间,我国科技企业孵化器运行的全要素生产效率指数平均值为0.946,体现为全要素生产率指数5.4%的负向增长,技术效率变化平均值为1.006,以0.6%的速度正向增长,技术进步变化平均值为0.941,表现为以5.9%的速度负向增长,纯技术效率平均值呈现下降趋势,下降速度为0.3%,规模效率平均值呈现上升趋势,上升增长速度分别为0.9%。（2）基于对我国科技企业孵化器超效率DEA的分析,超半数省份的科技企业孵化器的运行属于中等偏上水平,但整体来看区域间差异明显。总体上呈现出东部区域科技企业孵化器运行效率较高,中部运行水平较低,西部运行水平最低的格局。三阶段超效率DEA计算结果表明,各省份科技企业孵化器运行水平总体上有所下降。在剔除外部环境和随机误差之后,我国科技企业孵化器运行效率总体平均值下降了 1.9个百分点,大部分省份的运行超效率值也都有一定程度的下降,这说明这些省份受外部环境因素和随机误差的正向影响。（3）利用GM（1,1）模型对“十四五”期间我国科技企业孵化器的人力、物力等资源进行了预测。可以预见,科技企业孵化器规模、场地规模资金回报等均有较大幅度的提高都得到了稳步提升,对推动我国高新技术企业发展、产业布局和发展模式的转变具有重要意义。