质谱技术在生物化学领域的应用对制药工业的发展至关重要。这些研究包括生物分子组成分析，尤其是蛋白质，还有检测分子功能如结合配体的研究。在药物开发初期，质谱主要用于检测分析基本试剂和生物大分子。大量基于质谱的方法被开放和应用于高通量药物筛选。超滤主要用于溶质浓缩，除盐以及溶质替换。然而这种技术可成功应用于各类生物样品的纯化和一个较宽浓度范围的生物分子，包括治疗蛋白质，工业酶，天然蛋白质产物，以及诊断抗体。超滤质谱法广泛应用于开发与优化生物活性小分子，包括筛选组合库以及从萃取的天然产物中筛选生物活性化合物，测量热力学与动力学配体-受体结合参数，高通量代谢筛选等。在溶液相筛选配体的超滤质谱法试验对于反相药理学研究也有借鉴作用，在这些研究中所关注的生物大分子受体被分离开，只需检测与受体结合的配体。本文应用液质联用法鉴别了3种大黄蒽醌类化合物（大黄素、大黄酸、芦荟大黄素），5种甘草提取物（甘草苷、甘草酸、甘草素、甘草呋喃酮、甘草利酮），4种FAK抑制剂（Y11、PF-562271、PF-573228、PF-03814735）。超滤质谱法检测这些结合到蛋白质受体的药物活性小分子的结果十分可靠，重现性较好。可溶的人血清白蛋白与这些样品孵育，用超滤的方法将未结合与结合较弱的化合物分离，释放的配体用LC-ESI-MS检测。结果显示这些小分子药物与受体蛋白质有较强的结合活性。超滤与质谱技术的组合可提供足够的灵敏度与选择性来检测与靶蛋白结合的药物小分子，可广泛应用于从组合库与植物提取物中筛选生物活性化合物。