黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)遗传图谱构建及生长相关性状的QTL定位

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 15次 | 上传用户:wangtan2
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本研究采用拟测交策略,以野生(♂)和人工养殖(♀)黄颡鱼人工授精产生的100个F1个体为作图群体,用SSR、SRAP和TRAP三种DNA分子标记技术构建了黄颡鱼的遗传连锁图谱,并对5个与生长相关的性状进行了QTL分析。从50对SSR引物中扩增得到13个在双亲间呈现多态性并在子代分离的标记,其中母本标记4个,父本标记3个,母本和父本共有标记6个。卡方检验显示,13个微卫星标记在子代中的分离全部符合其期望比例。从196对SRAP引物中扩增得到89个标记,平均每对引物产生1.3个标记,其中母本标记38个,父本标记46个,母本和父本共有标记5个。卡方检验显示,母本标记中有8个发生偏分离,父本标记中有11个发生偏分离。子代分离符合期望比的标记占构图SRAP标记的比例为78.6%。从56对TRAP引物中扩增得到26个标记,平均每对引物产生1.2个标记,其中母本标记9个,父本标记8个,母本和父本共有标记9个。卡方检验显示,母本标记中有2个发生偏分离,父本标记中有3个发生偏分离。子代分离符合期望比的标记占构图TRAP标记的比例为80.8%。利用这些标记构建了黄颡鱼遗传连锁图谱。其中雌性图谱整合了51个标记,图谱的长度为585.5 cM;包括16个连锁群,连锁群的长度从8.2-127.4 cM,每个连锁的标记个数为2-8个;雌性图谱连锁群6的平均间隔最大为32.1 cM,连锁群14的平均间隔最小为4.6 cM,图谱整体平均间隔为16.3 cM。雄性图谱共有56个标记,图谱的长度为752.3 cM;包括15个连锁群,连锁群的长度从3.0-205.2 cM,每个连锁的标记个数为2-11个;雄性图谱连锁群6的平均间隔最大为28.8cM,连锁群14的平均间隔最小为5.0cM,图谱整体平均间隔为17.7 cM。共有图谱有20个标记,图谱的长度为231.3 cM;包括5个连锁群,连锁群的长度从5.3-84.7cM,每个连锁的标记个数为2-6个;共有图谱连锁群5的平均间隔最大为20.3cM,连锁群1的平均间隔最小为5.3cM,共有图谱整体平均间隔为13.8cM。估算的雌雄图谱的覆盖率分别为52.6%和58.7%。用黄颡鱼雌雄连锁图谱对5个与其生长相关的性状进行了QTL扫描,在雌性图谱上检测到1个头宽的QTL,定位于第7连锁群上,LOD值为3.2,可解释的表性变异为13%。在雄性图谱上分别检测到1个体高和体长的QTL,均定位于第1连锁群上。体高QTL的LOD值为2.4,可解释的表性变异为12%。全长QTL的LOD值为2.1,可解释的表性变异为11%。本研究获得的3个QTL均可尝试用于黄颡鱼的生长性状标记辅助育种。黄颡鱼遗传图谱的构建及生长相关性状的QTL定位为下一步进行黄颡鱼的分子标记辅助选择育种打下基础,并最终推动黄颡鱼的遗传改良。
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