湿地是重要的环境要素和自然资源，是国民经济和社会可持续发展的战略资源。湿地生态补偿机制是采用经济激励的事前补偿方式来保护湿地，可以在政府监管的基础上，将市场经济模式引入其中，具有灵活性与有效性。我国湿地生态补偿机制在地方实践上已经初具规模，为湿地的保护提供了很好的制度保障。但多是分散、无统一标准的机制。湿地资源是一个整体的生态系统，零乱分散的制度存在跨区域或跨流域的运用上存在很大的限制。所以，现在我国急需一个国家层面的湿地生态补偿机制框架来为地方实践提供法律与制度的指导。笔者在分析湿地生态补偿机制理论的基础上，借鉴了国内外相关国家与地区的湿地生态补偿的成功经验,对比其他重点领域的生态补偿的实践经验。从明确湿地生态补偿机制的构成要素入手，明确对湿地生态补偿制度的含义、补偿主体、补偿范围、补偿标准和补偿方式等方面。探讨湿地生态补偿机制的实施内容，健全湿地生态补偿管理公务合作机制；健立湿地开发风险评估；结合生态补偿发展湿地农业产业产业化模式；深化公众参与机制；实行湿地生态补偿金监管制度与政绩考核制度；完善湿地分类管理体系；配合法律文化机制宣传湿地生态补偿机制。旨在构建架构一个统一的国家层面的湿地生态补偿机制框架，使地方上的湿地生态补偿机制在此基础上，在统一制度指导下因地制宜的发展湿地生态补偿新模式。可以使湿地保护工作由面到点的去完善，从而更有效的解决湿地开发与保护的问题，达到保护湿地的目的。