对虾养殖业作为我国水产养殖业的重要组成部分,养殖过程中氮盐的过量积累会造成养殖水体的富营养化,这是虾池养殖水环境恶化的主要原因之一,因此,如何有效控制养殖水体中的氮盐浓度,保持水质的健康,是水产养殖业水处理的重要课题。细菌和微藻作为水产养殖水体中主要的微生物,在去除水体营养盐、净化水质、维持生态系统稳定方面有重要意义。但不同的微藻和细菌,在不同的水质环境中,适应性有较大的差别,因此选择合适的微藻和细菌构建藻菌体系才能实现其价值与应用目的。波吉卵囊藻（Oocystis borgei）是亚热带对虾养殖池塘中常见的一种绿藻,对对虾养殖池塘水环境有较好的调控效果。本论文主要研究内容是从波吉卵囊藻藻际微生物群落中分离出可培养的藻际细菌,再通过藻菌共培养实验验证细菌对藻生长的影响,以筛选合适的细菌与波吉卵囊藻构建藻菌体系,探究藻菌体系对水体中溶解态氮的吸收特性,并分析在氮浓度差异及不同培养体系条件下波吉卵囊藻转录组水平和micro RNA水平的差异,初步阐释了波吉卵囊藻及藻菌体系对氮浓度的响应机制。主要研究结果如下:1.通过分离纯化及鉴定后,得到5株可培养藻际细菌,分别为霍氏肠杆菌（Enterobacter hormaechei）、假交替单胞菌（Pseudoalteromonas sp.）、巴氏葡萄球菌（Staphylococcus pasteuri）、居海噬冷菌（Algoriphagus marincola）和除烃海杆菌（Marinobacter hydrocarbonoclasticus）。将5株藻际细菌分别与波吉卵囊藻进行共培养,其中,居海噬冷菌明显促进波吉卵囊藻叶绿素a的增长（P＜0.05）,比对照组增加45.74%。2.波吉卵囊藻与居海噬冷菌构建的藻菌体系相较于纯藻体系和纯菌体系,氮吸收速率显著提高（P＜0.05）,在以亚硝酸钠或氯化铵为氮源时,藻菌协同作用较明显。藻菌体系在对氮的吸收速率上存在“饱和效应”,在尿素或氯化铵为氮源时,氮浓度大于5 mmol·L-1出现吸收拐点,亚硝酸钠为氮源时大于3 mmol·L-1出现吸收拐点,过高的氮浓度会抑制藻菌体系对氮的吸收。3.分析了在低氮和高氮条件下培养的纯藻体系和藻菌体系中波吉卵囊藻的转录组。4组实验条件下共组装注释到28956条Unigenes,N50长度为2323 bp,GC含量为59.53%。在高氮浓度条件下,氮含量充足,两种培养体系中的藻细胞通过上调与谷氨酸合成相关的gln A和GLT1基因,加强了对氨氮的利用。藻菌体系相比于纯藻体系,两种氮浓度中与谷氨酰胺合成酶/谷氨酸合成酶（GS/GOGAT）相关的基因出现上调,藻细胞中氮代谢更加活跃。在高氮浓度条件下,不受氮限制,相比于低氮浓度条件,纯藻体系中与光合作用相关的Psa、Pet和Psb基因显著上调,光合作用能力得到了增强;而在藻菌体系中,这3个基因出现显著下调,细菌的加入,一定程度上阻碍了藻细胞的光合作用。4.所有处理组中一共检测到274个差异表达的mi RNA,部分差异mi RN A作用于氮代谢、光合作用等通路的靶基因,促进了相关基因表达量显著上调。综上所述,通过分离藻际可培养细菌得到的居海噬冷菌对波吉卵囊藻生长促进效果最好,二者构建的藻菌体系能有效吸收水体中的溶解态氮;转录组及mi RN A测序数据表明,藻菌体系能有效的在不同环境变化中通过调节自身基因表达调节氮代谢、光合作用等生命活动。