链霉菌Streptomyces sp.LZ35中TetR家族对次级代谢调控机制的研究

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链霉菌LZ35菌株分离自厦门集美潮间带土壤,是一株产格尔德霉素的海洋链霉菌。课题组前期研究完成了该菌株的全基因组测序。生物信息学分析结果表明,LZ35菌株基因组中包含了45个次级代谢产物生物合成基因簇,然而目前只从该菌中分到10类次级代谢产物,提示LZ35菌株的次级代谢受到了精密而复杂的代谢调控网络的控制,大多数基因簇在常规培养发酵条件下表达水平低甚至沉默。TetR家族是放线菌中数量最多的一类调控蛋白,在LZ35菌株中占编码蛋白总数的近2%,很有可能在LZ35的次级代谢调控中发挥重要作用。研究该家族对LZ35次级代谢的调控机制,有利于深入挖掘LZ35中蕴藏的新型次级代谢产物。生物信息学分析结果表明,LZ35_7692是一个TetR类调控蛋白,与链霉菌信号分子A-factor受体ArpA同源,而且与相邻的LZ35_7693以及A-factor合酶AfsA同源。为了阐明LZ35_7692在LZ35菌株次级代谢中的功能,本学位论文对LZ35_7692进行了系统深入研究。首先对该蛋白进行了异源表达和纯化,得到了纯度较高的带有His标签的重组蛋白,并尝试了对该蛋白进行结晶实验,得到了针簇状晶体,但没有收集到好的衍射数据;其次通过凝胶阻滞实验,证实了LZ35_7692可以结合到LZ35_7692和LZ35_7693基因中间的区域,这种结合可以被野生型LZ35菌株的发酵液解除;然后通过阿泊拉抗性盒替换的方法获得了LZ35_7692基因敲除突变株,并发现敲除突变株的代谢产物与野生型有HPLC差异峰出现,说明LZ35_7692可能阻遏了差异峰对应的化合物的生物合成。另外分别对LZ35_7693基因和LZ35菌株中另一个与A-factor合酶同源的LZ35_8405编码基因进行了敲除,突变株LZ35△7693在YEME培养基中的生长明显受到了抑制,但是未发现两个突变株与野生型的HPLC图谱有明显差异。最后对8个位于次级代谢基因簇上的TetR类蛋白编码基因的敲除突变株代谢产物的HPLC检测,发现与LZ35△heng相比,LZ35△heng△305O和LZ35△heng△6514出现了显著的差异峰,初步表明这两个基因可能对LZ35的次级代谢具有负调控作用。
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