本文基于创新理论、生态系统理论、生命周期理论、复杂系统理论等,综合运用问卷调查、主成分分析、验证性因子分析、结构方程模型、层次分析等多种方法,围绕核心企业主导下的区域创新生态系统的形成、运行和演化机制展开研究,主要结论如下:构成、特征和功能。核心企业主导下的区域创新生态系统由8大主体要素和4大环境要素构成。8大主体要素包括核心主导型企业、非核心主导型企业、大学、科研机构、政府、金融机构、中介组织和用户;4大环境要素包括科技环境、市场环境、资源环境和文化环境。具有核心企业主导性、区域边界多重性、双重生态性、系统结构复杂性和动态稳定性五大特征。具有创新资源集聚、创新风险规避、环境自适应和技术快速扩散四大基本功能。形成。从形成的驱动因素及驱动因素间的作用关系、协作伙伴选择两个角度来回答创新生态系统形成的动力机制这一问题。驱动因素实证结果表明:四大内部驱动因素—核心企业影响力驱动、资源和技术差异驱动、利益驱动、纽带关系驱动,是推进创新生态系统形成的直接动力;三大外部驱动因素—地域差异驱动、市场竞争驱动、政府支持驱动间接,是创新生态系统形成的间接动力。并就协作伙伴的选择问题,构建了基于层次分析法的匹配度模型。运行。从互利共生关系和创新水平两个角度来回答核心企业主导下的区域创新生态系统运行机制这一问题。以创新投入作为自变量,以创新产出作为因变量,利用Logistic扩展模型来研究创新生态系统运行过程中存在多个互利共生关系要达到均衡的条件。采用突变理论分析了创新生态系统中创新水平发展过程,并对四川省近年来创新水平发展进行了实证研究,结果表明:四川省创新生态系统创新力正处于突变水平。演化。从协同方式变化和种群结变化两个角度来回答核心企业主导下的区域创新生态系统演化机制这一问题。构建了基于群落结构和群落关系变化的创新生态系统创新力的演化过程模型,并用MATLAB对模型进行了数值仿真。仿真结果表明:创新生态系统中创新种群结构和群落关系演化能够很好的解释创新生态系统创新力的演化过程。