本文主要基于云南大学植物标本馆蕨类植物标本室(PYU)的馆藏标本，利用扫描电子显微镜(SEM)对68种4变种1变型的卷柏属孢子形态进行了观察，对每个种的孢子形态进行了详细描述，其中S.hengduanshanicolaW.M.Chu、S.effusevar.dulongjiangensisW.M.Chu、S.xichouensisW.M.Chu为首次SEM报道。同时，结合前人的研究结果，包括《云南植物志》、《中国植物志》中记载的种以及后来发表的一些种的孢子形态，本文共比较分析了中国71种4变种1变型的孢子形态。并结合形态学、细胞学、系统学资料对卷柏属分类进行了较深入的探讨分析。并根据孢子形态提出了分种检索表。　　研究结果如下:　　1.大孢子为球形、扁球形。三裂缝或无裂缝，裂缝突出，长达孢子半径1/2至直达赤道线，三裂缝光滑或具与近极面相似的纹饰。孢壁表面纹饰多样，多为瘤状、脊状或网状纹饰，也具有光滑、粗糙、疣状、蠕虫状、颗粒状等。大孢子还有一些特殊的纹饰例如三裂缝末端的环状结构、赤道环。大部分大孢子都具有特殊的细微纹饰，例如微刺、毛刺、片状刺、小疣、小颗粒、筛网状，绳索状纹饰等。　　2.小孢子半球形，扁球形或四面体型。极面观为圆形或圆三角形，赤道面观半圆形、椭圆形。多三裂缝，偶为单裂缝或无裂缝，三裂缝长达孢子半径的1/2至直达赤道线，裂缝多突出明显，有时与近极面纹饰相同而不明显。孢壁表面的主要纹饰类型为疣状、瘤状、块状、片状、棍棒状、芽孢状等纹饰，也有光滑、粗糙、鸡冠状、基部膨大的长棘刺状、基部宽的具条纹的刺状纹饰等。具有筛网、刺、颗粒等细微纹饰。　　3.卷柏属的大孢子和小孢子在纹饰上没有联系，但大孢子纹饰一致的种，其小孢子形态也必然近似。　　4.基于孢子形态，卷柏属的中国产3个亚属中，支持同形叶亚属为单系类群。而同穗亚属和异穗亚属的孢子形态则比较多样，孢子形态不支持这两个亚属的处理。　　5.通过我们的观察研究，同时结合大小孢子形态，中国产卷柏属同穗亚属的孢子形态可以分为8种大类型(每类型两种以上)和5种小类型(每类型仅一种);异穗亚属的孢子形态可分为大的4种大类型(每类型两种以上)和12种小类型(每类型仅一种)。　　6.通过孢子形态可以将一些在外部形态上相似的种区分开，孢子形态是种间分类的重要依据之一。