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背景与目的:卵巢癌是女性最常见的三大妇科恶性肿瘤之一。根据globalcancer最新的数据表明,卵巢癌的致死率仅次于宫颈癌排在所有女性恶性肿瘤死亡率的第八位。众所周知,基因组DNA的稳定性对于肿瘤的发生及发展至关重要。DNA损伤修复能力的减弱会增加DNA突变的概率,从而促进癌症的发生风险。虽然越来越多的研究开始关注基因的单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)改变与卵巢癌易感性之间的关系,但是与DNA修复基因相关的多态性研究仍然屈指可数,而且大部分的结论也存在一定程度的争议。因此,本研究旨在探究DNA修复通路相关核心基因的SNPs与卵巢癌易感性之间的关系。
方法:我们利用TaqMan探针法,分别对DNA修复通路相关核心基因(ERCC1、XPC、XPD、OGG1、PARP1、XRCC1)的18个潜在功能性位点进行基因分型,其中主要包括196个卵巢癌病例及272个健康对照。运用卡方检验比较人口学特征、初潮年龄、绝经状况以及不同SNPs基因型在病例组及对照组中的分布差异;利用单因素和多因素logistic回归计算比值比(oddsratio,OR)及95%置信区间(confidenceinterval,CI),分析各个位点基因型、危险双倍型及单倍型与卵巢癌发生率的关联强度;采用拟合优度卡方检验检测各个位点在对照组中的基因型频率是否符合Hardy-Weinberg平衡定律。
结果:
1、ERCC1基因三个SNPs(rs2298881C>A、rs11615G>A和rs3212986C>A)的多因素Logistic回归分析结果显示,三个位点的多态性改变与卵巢癌的发病风险并无显著的相关性。但是,与拥有0-1个危险双倍型的个体相比,拥有2-3个危险双倍型的个体患卵巢癌的风险下降了34%(P=0.033,校正OR=0.66,95%CI=0.45-0.97)。进一步分层分析显示,对于rs2298881CC基因型携带者来说,AC/AA基因型会显著降低生育个数≦1的女性个体患卵巢癌的风险,而且还会显著降低G2期肿瘤的发生率。对于rs3212986CC/AC基因型携带者来说,AA基因型会显著增加月经初潮年龄≦14岁、生育个数≦1的女性个体患卵巢癌的风险,而且显著增加某些病理分期肿瘤的发生率。
2、XPC基因三个SNPs(rs2228001A>C、rs2228000C>T和rs2607775C>G)的多因素Logistic回归分析结果显示,rs2228000CT基因型携带者患卵巢癌的风险显著低于CC基因型携带者(P=0.038,校正OR=0.65,95%CI=0.44-0.98)。进一步分层分析显示,相对于rs2228000CC基因型携带者来说,CT/TT基因型会显著降低个体患透明细胞癌、左侧肿瘤及病理分期为G3和G4期肿瘤的可能性。
3、XPD基因三个SNPs(rs3810366G>C、rs238406T>G和rs13181T>G)的多因素Logistic回归分析结果显示,所选的三个位点与卵巢癌的发病风险都无显著的相关性。但是,进一步的分层分析发现,对于rs238406TT基因型携带者来说,GT/GG基因型会显著降低BMI<24的女性个体患卵巢癌的风险,另外还会显著降低双侧肿瘤的发生率。
4、OGG1基因三个SNPs(rs159153T>C、rs293795A>G和rs1052133G>C)的多因素Logistic回归分析结果显示,在显性模型下,rs293795AG/GG基因携带者的患卵巢癌的风险显著低于AA基因型携带者(P=0.049,校正OR=0.36,95%CI=0.13-0.99)。进一步分层分析显示,对于rs1052133GG基因型携带者来说,CG/CC基因型会显著增加大小<5cm的肿瘤发生率。
5、PARP1基因两个SNPs(rs8679A>G和rs2666428T>C)的多因素Logistic回归分析结果显示,rs8679AG基因型携带者患卵巢癌的风险显著低于AA基因型携带者(P=0.032,校正OR=0.41,95%CI=0.18-0.93)。而且,rs8679AG/GG基因型携带患卵巢癌的风险也显著低于AA基因型携带者(P=0.026,校正OR=0.39,95%CI=0.17-0.90)。相较于0个危险双倍型的个体来说,拥有2个危险双倍型的个体患卵巢癌的风险下降了62%(P=0.023,校正OR=0.38,95%CI=0.17-0.88)。进一步分层分析显示,对于rs8679AA基因型携带者来说,AG/GG基因型的保护作用在BMI<24、初潮年龄≤14的女性人群中更加显著,另外还会显著减少浆液性卵巢癌的发生率。对于rs2666428TT基因型携带者来说,CT/CC基因型会显著降低生育个数≤1的女性个体患卵巢癌的风险,另外还会降低5-10cm肿瘤大小的发生率。通过PARP1两个位点的单倍型联合分析,我们发现GT单倍型个体患卵巢癌的风险显著低于野生型AT单倍型个体。
6、XRCC1基因四个SNPs(rs25487C>T、rs1799782G>A、rs2682585G>A和rs3810378G>C)的多因素Logistic回归分析结果显示,所选的四个位点与卵巢癌的发病风险并无显著的相关性。但是,进一步分层分析显示,相对于rs25487CC基因型携带者来说,CT/TT基因型会显著增加BMI≥24的女性个体患卵巢癌的风险,而且还会增加肿瘤大小<5cm和交界性肿瘤的发生率。对于rs1799782GG基因型携带者来说,rs1799782AG/AA基因型会显著增加某些病理分期肿瘤的发生率。对于rs2682585GG基因型携带者来说,AG/AA基因型会显著增加G1期肿瘤的发生率。
结论:DNA修复通路XPC基因rs2228000C>T、OGG1基因rs293795A>G、PARP1基因rs8679A>G的多态性改变可能与卵巢癌的易感性相关,但是该结果仍需利用更大规模的前瞻性研究来验证。
方法:我们利用TaqMan探针法,分别对DNA修复通路相关核心基因(ERCC1、XPC、XPD、OGG1、PARP1、XRCC1)的18个潜在功能性位点进行基因分型,其中主要包括196个卵巢癌病例及272个健康对照。运用卡方检验比较人口学特征、初潮年龄、绝经状况以及不同SNPs基因型在病例组及对照组中的分布差异;利用单因素和多因素logistic回归计算比值比(oddsratio,OR)及95%置信区间(confidenceinterval,CI),分析各个位点基因型、危险双倍型及单倍型与卵巢癌发生率的关联强度;采用拟合优度卡方检验检测各个位点在对照组中的基因型频率是否符合Hardy-Weinberg平衡定律。
结果:
1、ERCC1基因三个SNPs(rs2298881C>A、rs11615G>A和rs3212986C>A)的多因素Logistic回归分析结果显示,三个位点的多态性改变与卵巢癌的发病风险并无显著的相关性。但是,与拥有0-1个危险双倍型的个体相比,拥有2-3个危险双倍型的个体患卵巢癌的风险下降了34%(P=0.033,校正OR=0.66,95%CI=0.45-0.97)。进一步分层分析显示,对于rs2298881CC基因型携带者来说,AC/AA基因型会显著降低生育个数≦1的女性个体患卵巢癌的风险,而且还会显著降低G2期肿瘤的发生率。对于rs3212986CC/AC基因型携带者来说,AA基因型会显著增加月经初潮年龄≦14岁、生育个数≦1的女性个体患卵巢癌的风险,而且显著增加某些病理分期肿瘤的发生率。
2、XPC基因三个SNPs(rs2228001A>C、rs2228000C>T和rs2607775C>G)的多因素Logistic回归分析结果显示,rs2228000CT基因型携带者患卵巢癌的风险显著低于CC基因型携带者(P=0.038,校正OR=0.65,95%CI=0.44-0.98)。进一步分层分析显示,相对于rs2228000CC基因型携带者来说,CT/TT基因型会显著降低个体患透明细胞癌、左侧肿瘤及病理分期为G3和G4期肿瘤的可能性。
3、XPD基因三个SNPs(rs3810366G>C、rs238406T>G和rs13181T>G)的多因素Logistic回归分析结果显示,所选的三个位点与卵巢癌的发病风险都无显著的相关性。但是,进一步的分层分析发现,对于rs238406TT基因型携带者来说,GT/GG基因型会显著降低BMI<24的女性个体患卵巢癌的风险,另外还会显著降低双侧肿瘤的发生率。
4、OGG1基因三个SNPs(rs159153T>C、rs293795A>G和rs1052133G>C)的多因素Logistic回归分析结果显示,在显性模型下,rs293795AG/GG基因携带者的患卵巢癌的风险显著低于AA基因型携带者(P=0.049,校正OR=0.36,95%CI=0.13-0.99)。进一步分层分析显示,对于rs1052133GG基因型携带者来说,CG/CC基因型会显著增加大小<5cm的肿瘤发生率。
5、PARP1基因两个SNPs(rs8679A>G和rs2666428T>C)的多因素Logistic回归分析结果显示,rs8679AG基因型携带者患卵巢癌的风险显著低于AA基因型携带者(P=0.032,校正OR=0.41,95%CI=0.18-0.93)。而且,rs8679AG/GG基因型携带患卵巢癌的风险也显著低于AA基因型携带者(P=0.026,校正OR=0.39,95%CI=0.17-0.90)。相较于0个危险双倍型的个体来说,拥有2个危险双倍型的个体患卵巢癌的风险下降了62%(P=0.023,校正OR=0.38,95%CI=0.17-0.88)。进一步分层分析显示,对于rs8679AA基因型携带者来说,AG/GG基因型的保护作用在BMI<24、初潮年龄≤14的女性人群中更加显著,另外还会显著减少浆液性卵巢癌的发生率。对于rs2666428TT基因型携带者来说,CT/CC基因型会显著降低生育个数≤1的女性个体患卵巢癌的风险,另外还会降低5-10cm肿瘤大小的发生率。通过PARP1两个位点的单倍型联合分析,我们发现GT单倍型个体患卵巢癌的风险显著低于野生型AT单倍型个体。
6、XRCC1基因四个SNPs(rs25487C>T、rs1799782G>A、rs2682585G>A和rs3810378G>C)的多因素Logistic回归分析结果显示,所选的四个位点与卵巢癌的发病风险并无显著的相关性。但是,进一步分层分析显示,相对于rs25487CC基因型携带者来说,CT/TT基因型会显著增加BMI≥24的女性个体患卵巢癌的风险,而且还会增加肿瘤大小<5cm和交界性肿瘤的发生率。对于rs1799782GG基因型携带者来说,rs1799782AG/AA基因型会显著增加某些病理分期肿瘤的发生率。对于rs2682585GG基因型携带者来说,AG/AA基因型会显著增加G1期肿瘤的发生率。
结论:DNA修复通路XPC基因rs2228000C>T、OGG1基因rs293795A>G、PARP1基因rs8679A>G的多态性改变可能与卵巢癌的易感性相关,但是该结果仍需利用更大规模的前瞻性研究来验证。