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本研究采用RT-PCR技术对来自广西不同地区的120份健康猪扁桃体和84份流产胎儿进行CSFV检测，从得到的9份阳性病料中选取6份进行猪瘟病毒E2全基因的扩增、克隆、测序和遗传学分析，得到长度为1119bp、编码373个氨基酸残基的目的基因片段。 应用DNAstar序列分析软件对所测定的6个广西毒株与已知序列的HCLV、Shimen等毒株的相应片段进行同源性分析比较。结果显示，HCLV与Shimen核苷酸和推定的氨基酸的同源性分别为95.5％和94.6％，广西株与HCLV、Shimen株的核苷酸同源性分别为92.5％96.6％和89.8％～93.9％，推定的氨基酸同源性分别为90.0％～98.4％和86.3％～94.1％。广西毒株之间核苷酸和推定的氨基酸同源性分别为93.1％～99.6％和86.3％～99.2％。说明广西毒株之间的同源性很高，而广西毒株与Shimen之间同源性比较低，但与HCLV同源性较高。6个广西毒株E2基因的所有Cys位点都没变，可推测CSFV E2蛋白在抗原结构方面依然保持很高的稳定性。与标准毒株和疫苗毒相比，广西毒株在具有中和特性的B、C区域内721和724氨基酸位点发生了变异，这些变异可能导致E2蛋白的抗原性发生改变，从而使广西CSFV逃离疫苗毒的免疫保护。广西大学硕士论文广西猪疽病毒扁桃体和流产胎儿来源株E2基因的克隆、侧序及遗传学分析 把6个广西毒株与国内外已发表的CSFV相应序列进行比较，并建立了遗传进化树。该遗传树主要分为两大群和一个另类，广西株皆属于基因群I，与我国的主要参考毒株HCLV、Shimen属于同一基因群，说明广西CSFV株与HCLV、Shimen变异不大。