近些年来，国内诸多知名企业先后遭遇纳税风波，企业的财务和声誉都因此受到了极大的影响。国内企业管理层迫切的希望建立税务风险的管理机制，以此来发现并有效规避以往很容易被忽视的税务风险。本文正是基于这样的研究背景下，尝试从内部控制的角度探讨如何完善企业税务风险管理的问题。本文首先回顾了国内外内部控制与税务风险管理方面的理论研究，在此基础上提出了税务风险及税务风险管理的定义，阐明了内部控制、风险管理及税务风险三者之间的关系，归纳了税务风险内部控制的目标及应当遵循的六大原则。本文的第二章全面概括了税务风险内部控制的基本内容，税务风险评估作为其中的关键要素又被进一步的细分为税务风险识别、税务风险分析和税务风险应对三个组成部分，笔者详细介绍了税务风险识别及分析的主要方法及手段。第三章引入本文的案例企业（A公司），对A公司的生产经营、组织结构等方面的情况进行了初步介绍，描述企业目前的税务风险内部控制现状。第四章运用之前介绍的主要方法对A公司税务风险进行了综合分析，并总结了企业税务风险的主要成因。文章最后列数了A公司税务风险内部控制存在的主要缺陷并提出了相应的改善措施。本文的创新首先在于通过内部控制的角度研究税务风险的相关问题；另外，案例企业A公司具有典型的国内医药企业特征，通过对A公司的案例研究可以对其他医药企业的税务风险内部控制起到一定的借鉴意义。