新型农村合作医疗直接关系到我国几亿农民的健康和利益,是医疗体制改革的重要组成部分,是中央为解决“三农”问题而做出的重大决策,对于落实科学发展观,促进城乡协调发展,建设小康社会,具有十分重要的意义。基金的运行安全是合作医疗制度运行的基础,如果合作医疗基金的运行安全得不到保障,必然会影响合作医疗制度的实施,影响党和政府在人民群众心目中的形象。如何确保合作医疗基金筹集管理使用的安全、建立合作医疗基金安全运行机制是一项关系国家稳定、社会和谐的大事。该文主要从现行的新农合基金筹集使用管理的现状入手,采用理论与实证相结合、定性定量分析法,制度分析法,通过对青岛市新农合实施现状的了解以及对相关数据进行分析与对比,找出青岛市新农合在基金运行过程中存在的问题并对其进行分析,并针对这些问题提出完善青岛新农合基金运行的对策。文章首先对国内外农村医疗研究现状和成果进行梳理、分析影响我国新农合健康持续发展的因素,以及新农合基金有效运行管理的重要意义和研究背景；然后对我国的新农合医疗的发展状况进行介绍,对我国新农合医疗基金的理论和运行机理做出归纳,包括基金的筹集的标准、筹集的方式、使用政策、管理措施等。然后通过结合青岛市新农合的发展和特点,对青岛市新农合现行状况的实证分析,通过对新农合基金的筹集、基金的管理、基金的使用三个方面的理论研究和实际调查,运用计算机审计、数据分析、多维分析等技术方法,找出青岛市新农合基金在运行实施的过程中存在的问题,其中重点介绍了审查基金筹集中参合人数不真造成虚假套取上级资金情况,基金管理中个人骗取新农合和集体套取新农合资金的情况；并通过对这些新农合基金筹集管理的问题分析,从政策制度层面指出管理的问题成因。最后针对目前新农合存在的问题提出新型农村合作医疗基金筹集管理、提高使用效益的对策,主要从组织领导、基金筹集保障、基金运行监督、优化补偿机制和健全法律法规等几个层面提出科学的针对性建议,建立符合青岛本地特色的合作医疗资金安全运行机制,促进制度的可持续发展和本地区新农村建设,以维护农民切身利益。