【摘 要】
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[目的]1.比较宏基因组二代测序（mNGS）和常规病原体检测方法在异基因造血干细胞移植术（allo-HSCT）后感染性疾病的诊断效能,探讨mNGS在allo-HSCT患者的应用价值。2.观察分析mNGS诊断腺病毒（ADV）感染的allo-HSCT患者的临床特征及预后。[方法]1.回顾性分析了 2018年4月至2021年1月,在苏州大学附属第一医院接受allo-HSCT 后疑似发生感染的 149 例
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[目的]1.比较宏基因组二代测序（mNGS）和常规病原体检测方法在异基因造血干细胞移植术（allo-HSCT）后感染性疾病的诊断效能,探讨mNGS在allo-HSCT患者的应用价值。2.观察分析mNGS诊断腺病毒（ADV）感染的allo-HSCT患者的临床特征及预后。[方法]1.回顾性分析了 2018年4月至2021年1月,在苏州大学附属第一医院接受allo-HSCT 后疑似发生感染的 149 例患者的临床数据。所有病例根据最终临床诊断,分为感染组和非感染组。通过统计学比较两组mNGS与常规病原体检测方法的敏感性和特异性,分析mNGS结果的假阳性与假阴性结果,综合评价mNGS应用于allo-HSCT后患者病原体检测的诊断效能。2.回顾性分析苏州大学附属第一人民医院、淮安市第二人民医院及宁波大学附属人民医院等3个造血干细胞移植中心,2019年1月至2021年3月间,接受allo-HSCT后,通过mNGS诊断ADV感染的患者的临床资料,描述性研究不同终末器官ADV受累的临床表现、可能危险因素,并观察在现有治疗背景下的转归及预后。[结果]1 Allo-HSCT后疑似发生感染的149例患者,根据最终临床诊断,分为感染组（102例,68.5%）和非感染组（47例,31.5%）。其中男性患者91例,女性患者58例,中位年龄35.8（8-62）岁。相比于病原体培养阳性率,在不同送检标本:外周血（73.0%vs 8.1%,P＜0.05）、肺泡灌洗液（97.1%vs 19.0%,P＜0.05）、脑脊液（75.0%vs 0.0%,P＜0.05）、肺组织（50.0%vs 0.0%,P＜0.05）及尿液（100.0%vs 16.7%,P＜0.05）,mNGS阳性率均更高。mNGS结果的效能受病原体种类的影响:在细菌感染中,mNGS的敏感性高于培养（70.8%vs 22.9%,P＜0.05）,但特异性低于培养（84.0%vs 100%,P＜0.05）;在病毒感染中,聚合酶链式反应（PCR）和mNGS的敏感性都为100%,但PCR特异性高于mNGS（95.4%vs 28.7%,P＜0.05）;在真菌感染中,mNGS敏感性高于培养（57.1%vs 14.3%,P＜0.05）,但特异性较低（93.0%vs 100%,P＜0.05）。在细菌和真菌感染中,常规病原体检测方法（培养外）相比于mNGS,敏感性更高（93.8%vs 70.8%,P＜0.05;90.5%vs 57.1%,P＜0.05）,但特异性均低于 mNGS（68.0%vs 84.0%,P＜0.05;72.7%vs 93.0%,P＜0.05）。共有 84 例/149 例（56.4%）的患者根据 mNGS 结果,修正诊断并调整治疗方案,其中7例患者在常规病原体检测均为阴性的情况下,通过mNGS最终明确感染病原体（3例腺病毒感染,2例腺病毒与CMV混合感染,2例龟分枝杆菌感染）。纳入本研究的149例病例中,呈现mNGS假阳性和假阴性结果的各有8例（5.4%）。本研究中121例/149例（81.3%）患者最终治疗好转,28例/149例（18.7%）患者死亡。有9例患者死于感染,4例死于移植物抗宿主排异（GVHD）,2例死于多器官衰竭,2例死于本病复发。2.纳入研究的来自3个移植中心共有6例allo-HSCT患者,通过mNGS诊断ADV感染。ADV感染的临床表现为:ADV血症、ADV脑炎、ADV肝炎、ADV膀胱炎及ADV肺炎。5例感染患者接受西多福韦（CDV）治疗,4例接受静脉丙种免疫球蛋白（IVIg）治疗,1例接受CDV、IVIg、胸腺肽、低剂量的供体淋巴细胞输注（DLI）等治疗。1例患者ADV-DNA转为阴性,感染表现好转,但死于原发病复发,余5例均在ADV感染后死亡。[结论]1.mNGS可提高allo-HSCT患者的病原体检出率,尤其对于隐匿感染、罕见感染及复杂感染具有诊断效能优势,对allo-HSCT患者具有重要临床价值。2.Allo-HSCT患者ADV感染可累及多个器官,早期诊断困难,预后恶劣,尚缺乏有效治疗手段,mNGS对腺病毒感染早期诊断可能具有重要意义。
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