结直肠癌是常见的消化道肿瘤之一，其发生发展是多因素相互作用及影响的复杂过程，这也是肿瘤预防及治疗工作中面临的难题，伴随早期诊断、手术、放化疗、分子靶向治疗等水平的提高，结直肠癌在生存率方面得到一定改善，但结直肠癌仍是严重威胁生命的最常见肿瘤之一，且目前经证实的肿瘤驱动基因较少，其确切发病机制尚不清楚，因此为结直肠癌的防治提供筛查标志物及新靶点，从分子水平揭示其发病机制显得至关重要。　　基因芯片（gene chip）又称DNA微阵列（DNA microarray），是当前生命科学领域相关研究中最前沿的生物技术之一，基因芯片作为一种高效、大规模获取生物信息的技术，能检测肿瘤组织与正常组织之间的差异表达基因，使人类可以在分子水平上探索健康和疾病的奥秘，其飞速发展将为人类疾病的诊断、治疗及防治开辟全新的途径。　　生物信息学是一门综合了生命科学、计算机科学及信息技术的学科，它能通过计算机来釆集、筛选、处理、解释海量的生物信息数据，因此广泛的应用在生物工程行业、临床医学与流行病学等研究，为发现新规律并阐述其生物学意义奠定了基础。目前，生物信息学已广泛地渗透到生命科学的各个研究领域，成为了不可或缺的重要工具。　　方法：本研究利用GEO公共平台数据库中的结直肠癌基因芯片(总共34例样本)，包括17例原发结直肠癌组织及17例癌旁组织，利用R语言及Bioconductor相应程序包筛选出差异基因，并将筛选的差异基因进行聚类分析、GO本体分析、KEGG通路分析、STRING蛋白互作关系、Cytoscape作图、Gopubmed文本挖掘等。　　结果：利用GEO公共平台的芯片数据，共筛选出差异基因201个(差异倍数＞4倍，校正后P＜0.05)，其中下调基因131个，上调基因70个，将差异基因进行生物信息学分析提示这些基因富集在“肿瘤转录失调、细胞粘附分子、膀胱癌、趋化因子”等信号通路上，并参与“细胞增殖调控、细胞生长、免疫反应、趋化因子调节信号通路、Wnt受体分解过程”等生物学进程，进一步分析筛选出“IL8、SST、MYC、CXCL1、CXCL11、CXCL13、CXCL3、P2RY14、PPBP、KLF4、MMP1、BMP2、BMP4、MMP7、GCG、LGR5、MUC2”等17个与结直肠癌发病关系密切的差异基因，其中大部分基因也是差异性较大的基因，对这些差异基因进行文本挖掘，发现其中大多数基因与结直肠癌的发生发展有紧密联系，并发现P2RY14、BMP4基因在结直肠癌中研究较少，利用生物信息学进一步分析该基因，并了解其细胞表达、分子功能、生物学过程、参与的通路及目前研究现状，为后续实验提供理论依据。