本文针对私募股权投资过程估值不确定问题展开研究。考虑到私募股权投资不愿披露信息的特性,笔者在研究方法上引入控制论分析黑箱时所用黑箱理论的原理,将私募股权估值作为一个估值黑箱来研究估值不确定性问题。在分析了私募股权投资整个投资循环的基础上,全文基于创业板上市公司历史数据,运用因素分析法、统计分析法、例证法等方法,围绕投资前与退出前两个环节对估值不确定性机理展开一系列研究。研究得出：1、投资前的估值不确定性是因现有的估值方案中没把博弈双方完整纳入估值对象,PE的缺失导致估值黑箱不完整、不稳定引起的。事实上,PE的无形资产对获得投资后的目标企业这个估值黑箱的成长影响很大,这是前人研究中没注意到的一个基础性问题,其根源来自中西方的文化差异。正是PE无形资产的投入改变了估值黑箱的成长轨迹,使之表现出不同的估值特性。2、退出前的估值不确定性与退出市场的不确定息息相关,由于目前不同退出方式收益悬殊太大,导致PE一旦未能实现IPO退出则对估值不确定造成巨大的影响,鉴于每种退出方式的收益与不同退出市场间的交易成本息息相关,为缩小退出前估值不确定程度,建议在不同交易成本设计下构建多层次资本市场来最终降低估值不确定性。根据研究的结果针对目前实际存在的问题提出以下建议：1、对PE而言,从创业板数据的多项指标表明过去PE在投资前估值所采用的市盈率倍数偏高,今后应该要适度调低投资前市盈率的倍数,以避免退出时一二级市场“估值倒挂”带来的风险导致的估值不确定；2、鉴于PE个体能力不同表现出的估值差异不是估值不确定性的表现,PE应该通过选择不同的目标企业来实现自己应有的价值。3、对监管层而言,可以在不同交易成本设计下构建多层次资本市场来最终降低估值不确定程度。