近41年来,我国经济取得了快速发展,但遭受破坏的环境和生态状况却没有得到真正有效的改善。为了实现经济发展与生态环境保护的协调和可持续发展,本文把中国生态环境保护与经济发展看成一个整体的系统,运用系统思维和系统方法,研究中国经济发展与生态环境的关系及其协调度,并进一步从更大的范围分析系统的影响因素,从而提出相应的对策建议。首先,界定了经济-生态环境系统的要素、子系统以及系统的环境,构建了系统的内涵结构模型;从系统的关联性、目的性等系统特性与功能的角度出发,构建了系统的逻辑结构模型;并结合系统学理论,分析了经济-生态环境系统的复杂特性。接着,构建了经济-生态环境系统的评价指标体系,并引入了M2的负指标以修正GDP的泡沫,得出综合评价值;利用EViews软件,建立以Lotka-Volterra模型为基础的耦合协调度模型,运用模型进行评价,分析了两者的相互影响因子以及协调度,得出中国经济发展与生态环境保护的整体关系和协调度变化趋势。研究结果表明,中国近20年经济与生态环境的协调度,具有从较为协调转向逐渐失调的下降趋势,不过后面两年有所回升;经济子系统加上M2后的修正模型也没有改变原有的变化趋势,只是改变了差距的幅度。然后,运用流率入树方法和Vensim软件,依据系统的内涵结构,从包括政治、社会、文化等更大范围的系统梳理了相关影响因素;运用PCA方法和SPSS软件,从64个影响因素指标中,提取出8个重要影响因子。最后,综合考虑在系统评价中反映出的问题和提取的重要影响因素,对问题分类进行讨论分析,并构建经济-生态环境系统的控制结构模型。同时,运用整体性、关联性、多样性、开放性、协同性等系统学原理,提出了相应的治理对策,为经济发展速度的调整和生态环境的优化等研究决策提供新的参考依据。