2013年11月以来，我国房地产土地增值税的清算工作成为了税收的热点问题。针对多家房地产上市公司是否欠缴土地增值税的问题，国家税务总局有关负责人、税务学者和各大媒体展开了激烈的讨论。可想而知的是，加强土地增值税管理信息系统建设，进一步完善土地增值税制度，加强土地增值税征管，推动土地增值税清算工作全面深入开展等工作正在酝酿，因此，结合我国房地产业的发展现状，制定一套有效的土地增值税纳税评估体系，对我国基层税务人员以及房地产市场的健康发展都显得尤为重要。本文结合目前房地产企业财务核算的特点以及土地增值税税制结构和目前土地增值税征管模式，在纳税评估理论基础的指导下，设计了土地增值税的纳税评估体系。根据目前对土地增值税征管的不同阶段，本文将土地增值税的纳税评估指标分为预征评估指标、清算评估指标和综合评估指标。并通过A房地产开发公司缴纳土地增值税的实际情况，检验评估指标的可行性。通过评估后的结果与第三方标准数据比较，找出疑点，并约谈相关人员，找出纳税问题所在，从而证明本文所设计的评估体系具有预期的实效性。