【摘 要】
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甘蓝型油菜(Brassica napus)是一种非常重要的油料作物。热激蛋白(Heat shock proteins,Hsps)和热激转录因子(Heat shock factors,Hsfs)普遍存在于各种植物中,它们对植物的生长发育及抵抗非生物胁迫中起到了至关重要的作用。为全面、深入的了解甘蓝型油菜Hsf和Hsp基因家族的信息,主要包括以下六个方面:(1)对甘蓝型油菜等芸薹属3个物种和拟南芥的H
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甘蓝型油菜(Brassica napus)是一种非常重要的油料作物。热激蛋白(Heat shock proteins,Hsps)和热激转录因子(Heat shock factors,Hsfs)普遍存在于各种植物中,它们对植物的生长发育及抵抗非生物胁迫中起到了至关重要的作用。为全面、深入的了解甘蓝型油菜Hsf和Hsp基因家族的信息,主要包括以下六个方面:(1)对甘蓝型油菜等芸薹属3个物种和拟南芥的Hsf和Hsp基因家族进行了鉴定及生物信息学分析。在甘蓝型油菜中鉴定出了95个Hsf、63个s Hsp、69个Hsp60、46个Hsp70、17个Hsp90和18个Hsp100基因。根据系统发育树拓扑结构和亚细胞定位信息,将家族基因分为不同的亚组。在进化树上甘蓝型油菜相关基因和白菜及甘蓝的关系比拟南芥更为亲近,这与物种的亲缘关系相一致。(2)甘蓝型油菜的部分Hsf和Hsp家族数量并不等于白菜和甘蓝的基因数量之和,表明在两个二倍体(白菜、甘蓝)杂交融合为四倍体甘蓝型油菜之后发生了基因的丢失和复制。(3)基因结构和保守基序分析表明,家族整体上基因结构和保守基序差异较大,但是同一亚组内具有较高的一致性。(4)通过对基因重复类型的鉴定及统计分析表明,全基因组加倍或片段重复对Hsf和各个Hsp基因家族的扩张起到了非常重要的作用。(5)转录组分析显示多数甘蓝型油菜Hsf和Hsp家族基因在根和叶中呈现表达,其中Hsp70、Hsp90和Hsp100家族基因表达程度较高。并且部分基因表达具有明显的组织特异性。(6)鉴定了甘蓝型油菜在高温、低温及干旱胁迫下的差异表达Hsf和Hsp家族基因。发现部分基因同时响应高温及其它逆境胁迫的现象。构建了Hsf和Hsp家族基因在逆境胁迫下的共表达调控网络,发掘出了调控网络中可能起关键作用的核心基因。图40幅;表27个;参121篇。
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