【摘 要】
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【目的】利用公共数据集探讨人ERG基因mRNA在宫颈癌的表达及其临床预后价值,从而指导宫颈癌的个体化治疗。【方法】从美国癌症基因组图谱数据库（TCGA）中下载宫颈癌患者基于转录组测序得到的表达数据以及临床病理资料。为了对TCGA数据集分析结果进行验证,从美国国立生物技术信息中心的基因表达数据库（NCBI GEO）公共数据库中搜集和下载了关于宫颈癌患者基因芯片的表达数据以及临床随访数据。本研究首先比
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【目的】利用公共数据集探讨人ERG基因mRNA在宫颈癌的表达及其临床预后价值,从而指导宫颈癌的个体化治疗。【方法】从美国癌症基因组图谱数据库（TCGA）中下载宫颈癌患者基于转录组测序得到的表达数据以及临床病理资料。为了对TCGA数据集分析结果进行验证,从美国国立生物技术信息中心的基因表达数据库（NCBI GEO）公共数据库中搜集和下载了关于宫颈癌患者基因芯片的表达数据以及临床随访数据。本研究首先比较了TCGA数据集和GEO数据集中正常宫颈组织和宫颈癌组织中ERG mRNA的表达差异。同时,分析ERG基因表达水平和宫颈癌患者各项临床病理指标的相关性。接着,在TCGA数据集中对ERG基因表达水平和宫颈癌患者总体生存率以及无进展生存率进行Kaplan-Meier生存分析和Log-rank P检验,并对ERG基因表达以及各项临床病理指标分别进行了单因素和多因素Cox回归分析。最后,为了进一步确认ERG基因表达水平在宫颈癌患者中的预后价值,在GEO公共数据集中对ERG基因的预后价值进行了验证。【结果】与正常宫颈组织相比,宫颈癌组织中ERG mRNA表达显著下调（Mann-whitney U检验,P＜0.05）。宫颈癌患者ERG mRNA表达水平与N分期和组织学类型显著相关（卡方检验,P＜0.05）,与年龄、T分期、M分期、AJCC临床分期以及组织学分级的相关性均未达显著水平（卡方检验,P＞0.05）。对TCGA数据集进行Kaplan-Meier生存分析,发现ERG mRNA表达水平与宫颈癌患者总体生存率和无进展生存率均存在显著相关性（Log-rank检验,P＜0.05）。随后用GEO公共数据集验证时也发现ERG基因表达和宫颈癌患者总体生存率显著相关（Log-rank检验,P＜0.05）。此外,单因素Cox回归分析显示,T分期、N分期、M分期、AJCC临床分期和ERG mRNA表达均能显著影响患者的预后（P＜0.05）,而年龄、组织学分级以及组织学类型则与宫颈癌患者预后相关性未达显著水平（P＞0.05）;多因素Cox回归分析显示,N分期和ERG基因表达水平均能独立影响患者预后（P＜0.05）。【结论】1、人ERG mRNA表达水平在宫颈癌组织中显著下调,并且ERG基因表达水平与宫颈癌患者N分期及组织学类型显著相关。2、ERG基因表达水平和患者预后显著相关,T分期、N分期和ERG基因表达水平均是患者预后的独立因素。3、检测ERG基因表达水平可帮助对宫颈癌患者预后进行评估,从而指导患者的个体化治疗。
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