水稻稻瘟病是一种由Magnaporthe oryze引起的毁灭性病害,严重危害着稻米的生产安全。选育和种植抗病品种是控制稻瘟病的一种经济有效且绿色环保的措施。因此,新的抗性基因的挖掘和有效利用是水稻稻瘟病抗性育种的重要基础。本研究通过对含Pik和Pi2位点的水稻近等基因系进行抗性鉴定表明,Pik和Pi2位点在中国大部分病圃均表现较持久高效的抗性。32个抗源材料中的分子检测结果表明Pik和Pi2位点在分别含有16和25个,其中10个抗源材料中同时含有这两个位点；序列测定、氨基酸预测和序列比结果表明：Pikm、Pikh和Pi2分别在抗源12、14、24和32；11和19；5、6、9、10、11、13、16和18中被检测到,并且含有这些位点的抗源材料在临安、蒲江或者桃江病圃中表现抗病,而含有这3个位点的近等基因系在这3个病圃中均表现感病。同源序列聚类分析表明：抗源15、23和28中的Pik位点与其他的序列同源关系较远；而抗源3和14中的Pi2位点形成较独立分支。抗源中Pik和Pi2位点的等位基因变异分析和抗性表型鉴定,为发掘功能性等位基因和合理的利用这些抗源提供了基础。