延边黄牛TCAP、DECR1、PRKAG3基因SNP检测及与肉质性状的关联分析

来源 :延边大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zcom0907
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本研究以延边黄牛为研究对象,利用PCR-SSCP方法对TCAP、DECR1、PRKAG3基因进行检测,分析基因的遗传特性并寻找与肉质性状相关的SNPs位点,分析SNP位点不同基因型与生产性状的关联关系。结果如下:(1) TCAP基因存在3个突变位点,分别为267位点的C-T突变、300位点的T-C突变、336位点的A-G突变;DECR1基因存在2处突变,分别为23263处的A-G突变,23473处的A-G突变;PRKAG3基因检测到4738处存在C-T突变。(2)三个基因除DECR1基因不处于Hardy-Weinberg平衡状态外,其他均处于Hardy-Weinberg平衡状态。遗传变异情况分析表明,TCAP基因的纯合度、杂合度、有效等位基因数分别为0.6322、0.3678、1.5818;DECR1基因的纯合度、杂合度、有效等位基因数分别为0.6922、0.3078、1.4447;PRKAG3基因的纯合度、杂合度、有效等位基因数分别为0.6113、0.3887、2.5727。三个基因的多态信息含量分别为0.3013、0.2604、0.3051,均为属于中度多态。(3) TCAP、DECR1、PRKAG3个基因与肉质性状的相关分析发现,TCAP基因基因型AA对蒸煮损失有一定的负面影响;基因型AB对c*24(彩度)存在一定的正面影响。DECR1基因型AA对蒸煮损失、pH24性状有一定的负效应。基因型BB对pH1有一定的负面影响;基因型AB对L*1(亮度)有一定的正面影响。PRKAG3基因基因型AB对嫩度存在一定的正面影响;基因型AB对a*24(红色度)和b*24(黄色度)值有一定的负而影响。(4) TCAP、DECR1、PRKAG3三个基因与脂肪酸含量的连锁分析表明,DECR1基因的基因型BB对肉豆蔻酸的组成有一定的负面影响;基因型BB对硬脂酸、亚麻酸有一定的正面影响;PRKAC3基因的基因型BB与油酸存在一定的正相关。TCAP基因各基因型之间没有发现显著差异。(5) TCAP、DECR1、PRKAG3三个基因与氨基酸含量之间的连锁分析发现,TCAP基因基因型BB对甘氨酸含量存在一定的正面影响。DECR1基因基因型BB对组氨酸与赖氨酸有一定的负面影响。PRKAG3基因基因型AA对天冬氨酸有一定的正面影响;基因型AB对谷氨酸、丙氨酸、脯氨酸、精氨酸和缬氨酸含量均有定的正面影响。
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