硝酸根是影响侧根发生的重要因素，一方面，硝酸根对于侧根发生必不可少，而硝酸根浓度过高则又抑制了侧根的发生。在浓度相对较低的条件下（＜50mM）硝酸根只影响侧根生长，而对主根没有明显影响；随着浓度的提高，硝酸根对主根的延伸也起到了明显的抑制作用。同时，较高浓度的硝酸根还降低了生长素的敏感度。 生长素极性运输 （polar auxin transport, PAT） 对侧根发生和根尖向地性起着重要的调节作用，添加外源生长素极性运输抑制剂不仅抑制了侧根发生，同时还使根尖丧失了向地性。类黄酮物质由于分子结构上同PAT抑制剂NPA十分相似，长久以来被人们认为内源的生长素极性运输抑制剂。但我们在实验中发现，类黄酮对根系发生的抑制是与高N相联系的。对于向地性，类黄酮中的一种——quercetin不但不抑制，反而促进向地性——诱导超向地性。 我们在最适合侧根发生的硝酸根浓度（0.2 mM）条件下，通过转移实验来研究类黄酮对于侧根发生的影响。在我们的体系中，quercetin （Q）对主根和侧根的延伸都有一定的抑制作用。原基统计结果表明，Q对侧根原基发生的影响和NPA有着根本的不同：Q不影响侧根原基的发生，而只影响原基的延伸，使侧根发生比正常延迟一步。NPA则不同，它既抑制原基的发生，还影响到原基的延伸。测量拟南芥下胚轴长度结果表明，Q促进了下胚轴的延伸，这一表型与生长素极性运输增强相联系。 DR5::GUS报告株系染色和[¹⁴C]IAA测量拟南芥茎段的生长素运输能力结果表明Q不但不抑制反而促进了生长素运输。 在向地性方面，我们发现Q能够增强拟南芥的向地性——诱导超向地性。一方面Q促进了下胚轴的向光生长，另一方面，促进了根尖的向地性，在80°培养时，Q诱导根尖钻入培养基中。在旋转培养时，经过Q处理的根尖比对照提前达到90°。药物学实验结果表明，Q诱导超向地性来自于末端特异性结构，同时细胞内的Ca²⁺和cAMP等二级信使也参与了这一过程，并且生长素极性运输也是发生超向地性所不可缺少的条件。所有的这些结果表明，quercetin在植物中不是直接作为尘长素极性运输抑制剂存在的，而更多的是在信号转导水平上进行调节，从而影响到尘长素极性运输。