论文部分内容阅读
细毛羊皮肤毛囊的发育直接影响羊毛的产量和品质，因此研究细毛羊毛囊发育的调控机制，对于提高羊毛的产量和细度具有重要的意义，也是当前细毛羊育种工作中非常重要的内容。目前，表观遗传修饰在毛囊发育过程中扮演重要角色，可调控基因表达。转录因子在基因表达调控的过程中发挥重要作用，相应的研究也是目前热点之一。因此，可从表观遗传学层面，研究调控苏博美利奴羊毛囊发育的表观遗传标记及其转录因子。
本研究首先利用qRT-PCR技术检测了ITGB2、IGFBP4、IGFBP2基因在苏博美利奴羊不同细度皮肤组织中的表达水平；然后使用BSP方法检测了ITGB2、IGFBP4、IGFBP2基因的DNA甲基化修饰状态，并进行了ITGB2、IGFBP4、IGFBP2基因DNA甲基化水平与表达水平的相关性分析；而后通过生物信息学预测并筛选出ITGB2、IGFBP4、IGFBP2基因关键的转录因子，针对筛选出的转录因子进行生物信息学分析，以期探究目的基因的调控方式。主要结果如下：
(1)ITGB2、IGFBP4、IGFBP2基因在苏博美利奴羊不同细度皮肤组织中均有表达，其中ITGB2基因在苏博美利奴羊极粗皮肤组织中的表达量极显著高于极细皮肤组织(P＜0.01)，IGFBP4基因在苏博美利奴羊极细皮肤组织中的表达量极显著高于极粗皮肤组织(P＜0.01)，IGFBP2基因在苏博美利奴羊极细皮肤组织中的表达量高于极粗皮肤组织。
(2)ITGB2基因在苏博美利奴羊皮肤组织呈高甲基化，极细皮肤组织甲基化概率高于极粗皮肤组织；IGFBP4基因在苏博美利奴羊皮肤组织均呈低甲基化，极粗皮肤组织甲基化概率高于极细皮肤组织；IGFBP2基因在苏博美利奴羊皮肤组织均呈低甲基化，且发现ITGB2、IGFBP4基因的DNA甲基化与表达量呈极显著负相关(P＜0.01)。
(3)基于生物信息学分析，共筛选出6个关键的转录因子JUN、EP300、SP1、PAX6、ETS1、MYOD1，为寻找更多与毛囊发育相关的转录因子奠定基础。
综上所述，本研究分析了ITGB2、IGFBP4、IGFBP2基因在苏博美利奴羊不同细度皮肤组织中的DNA甲基化水平与表达量，并筛选出6个关键的转录因子JUN、EP300、SP1、PAX6、ETS1、MYOD1，为探究与毛囊发育相关的表观遗传标记和转录因子提供理论依据。
本研究首先利用qRT-PCR技术检测了ITGB2、IGFBP4、IGFBP2基因在苏博美利奴羊不同细度皮肤组织中的表达水平；然后使用BSP方法检测了ITGB2、IGFBP4、IGFBP2基因的DNA甲基化修饰状态，并进行了ITGB2、IGFBP4、IGFBP2基因DNA甲基化水平与表达水平的相关性分析；而后通过生物信息学预测并筛选出ITGB2、IGFBP4、IGFBP2基因关键的转录因子，针对筛选出的转录因子进行生物信息学分析，以期探究目的基因的调控方式。主要结果如下：
(1)ITGB2、IGFBP4、IGFBP2基因在苏博美利奴羊不同细度皮肤组织中均有表达，其中ITGB2基因在苏博美利奴羊极粗皮肤组织中的表达量极显著高于极细皮肤组织(P＜0.01)，IGFBP4基因在苏博美利奴羊极细皮肤组织中的表达量极显著高于极粗皮肤组织(P＜0.01)，IGFBP2基因在苏博美利奴羊极细皮肤组织中的表达量高于极粗皮肤组织。
(2)ITGB2基因在苏博美利奴羊皮肤组织呈高甲基化，极细皮肤组织甲基化概率高于极粗皮肤组织；IGFBP4基因在苏博美利奴羊皮肤组织均呈低甲基化，极粗皮肤组织甲基化概率高于极细皮肤组织；IGFBP2基因在苏博美利奴羊皮肤组织均呈低甲基化，且发现ITGB2、IGFBP4基因的DNA甲基化与表达量呈极显著负相关(P＜0.01)。
(3)基于生物信息学分析，共筛选出6个关键的转录因子JUN、EP300、SP1、PAX6、ETS1、MYOD1，为寻找更多与毛囊发育相关的转录因子奠定基础。
综上所述，本研究分析了ITGB2、IGFBP4、IGFBP2基因在苏博美利奴羊不同细度皮肤组织中的DNA甲基化水平与表达量，并筛选出6个关键的转录因子JUN、EP300、SP1、PAX6、ETS1、MYOD1，为探究与毛囊发育相关的表观遗传标记和转录因子提供理论依据。