手性起源模型化合物—核苷-5′-N-磷酰化氨基酸甲酯化合物的合成及其分子模拟

来源 :厦门大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jiang1978
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生物分子的手性均一是怎么产生的?在生命体中,蛋白质都是由L型氨基酸和甘氨酸(无光学活性)构成,RNA、DNA聚合物全部是由D型核糖构成。自从巴斯德发现了生物分子的光学活性之后,这个问题就一直困扰着科学家,至今仍然是个未解之迷。我们实验小组在以前的实验中发现了核苷-5-N-磷酰化氨基酸甲酯化合物的核苷碱基以顺式构象存在。由此,我们推测核苷对L型氨基酸的选择是由于氨基酸与核苷上碱基弱相互作用,因此本文首先合成一系列的核苷-5-N-磷酰化氨基酸甲酯化合物,试图观察核苷上碱基与氨基酸甲酯的NOE,并建立一个手性模型,进行分子模拟,计算相对生成焓。 首先利用Abuzov反应的原理,一锅法合成核苷-5-氢亚磷酸酯。将保护的天然核苷先与三氯化磷反应,然后与醇解试剂作用,简单方便地合成了保护的天然核苷-5-氢亚磷酸酯。叔丁醇与其它醇(1∶1)混合为醇解试剂,可以较高的产率得到核苷-5-氢亚磷酸酯。使用不同的醇解试剂,可以得到相应的不同核苷-5-氢亚磷酸酯。然后利用Atherton-Todd反应,在四氯化碳和三乙胺条件下,以核苷-5-氢亚磷酸酯和氨基酸甲酯为原料,合成了一系列核苷-5-N-磷酰化氨基酸甲酯。该方法具有反应条件温和,反应时间短,产率较高等优点。 论文对一些尿苷-5-N-磷酰化氨基酸甲酯化合物进行电喷雾质谱多级质谱分析,发现了一个质谱中的重要的重排机理,即钠离子加合物中氨基酸甲酯上的甲氧基从羰基到磷酰基的重排。这个裂解规律以及重排机理对鉴定此类化合物结构是很有用的。 最后,我们建立了手性起源的模型,利用hyperchem6.0软件的MM力场计算此类化合物的相对生成焓。计算结果显示了核苷对L型氨基酸的优先结合几率是59.21%,而对D型氨基酸的优先结合几率为40.79%。比较有意思的是,在五种古老氨基酸中,L型氨基酸被A、G、C、U四种核苷的的选择率皆为90.00%,而D型氨基酸的选择率则为10.00%。因此,古老氨基酸手性的选择似乎遵守了“立体化学/物理化学决定论”,这和基因密码子起源是一致的。另外,计算结果还显示了氨基酸对核苷也有选择性。最低生成焓的化合物主要是鸟苷和胞苷衍生物,尤其是鸟苷衍生物。
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