福建地区维生素D受体基因多态性与多发性骨髓瘤的相关性研究

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:libolb666
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目的:研究福建地区健康人群和多发性骨髓瘤(Multiple Myeloma,MM)患者维生素D受体(Vitamin D Receptor,VDR)基因多态性及其单体型的分布,并探讨VDR多态性与MM的相关性;分析VDR多态性在福建地区与世界不同种族人群中的分布;以期发现MM患者在本次研究位点邻近新的SNP和突变。方法:采用病例-对照研究方法,收集福建地区40例MM患者和84例健康体检者(同期同地区年龄性别匹配)的外周血,运用聚合酶链反应(PCR)和DNA直接测序法对VDR基因FokI、BsmI、ApaI、TaqI位点进行SNPs检测,运用SHEsis在线生物信息学软件对以上位点的基因型、等位基因、连锁不平衡(LD)、单体型分布特征进行分析。同时收集MM患者起病年龄、性别、吸烟史、分型、ISS分期、起病情况、25-羟总VD、β2微球蛋白、血清白蛋白、乳酸脱氢酶、血钙、血红蛋白等临床资料,运用PASW Statistics18统计学软件进行基因型与临床资料相关性分析。结果:1、病例组和对照组各位点均符合Hardy-Weinberg遗传平衡,BsmI位点A等位基因分布频率在实验组(8.7%)显著高于对照组(2.4%),差异有统计学意义(P=0.025),为MM高风险性等位基因;TaqI位点C等位基因分布频率在实验组(10.5%)高于对照组(3.6%),差异有统计学意义(P=0.030),为MM高风险性等位基因。未发现4个位点的基因型和FokI、ApaI的等位基因与MM患病风险相关。2、分析病例组4个位点基因型与临床指标的相关性,发现FokI与性别(P=0.018)、吸烟史(P=0.008)、血钙(P=0.016),ApaI与起病年龄(P=0.019)具有相关性。未发现这两个位点与其它临床指标有相关性。BsmI、TaqI位点与所收集的临床指标均无相关性。3、福建地区健康人群FokI位点频率与所报道的汉族北京人群、日本人群、欧洲人群频率无统计学差异(P>0.05);与非洲人群的频率有显著性差异(P<0.05)。BsmI位点频率与所报道的汉族北京人群频率无统计学差异(P>0.05);与日本人群、欧洲人群、非洲人群频率有显著性差异(P<0.05)。ApaI位点频率与所报道的汉族北京人群和日本人群频率无统计学差异(P>0.05);与欧洲人群、非洲人群的频率有显著性差异(P<0.05)。TaqI位点与所报道的汉族北京人群频率无统计学差异(P>0.05);与日本人群、欧洲人群、非洲人群的频率有显著性差异(P<0.05)。4、分析遗传标记两两之间连锁不平衡,发现4个位点中BsmI-TaqI之间存在连锁不平衡(LD),而本次发现的BsmI、TaqI等位基因与MM易感相关,说明BsmI、TaqI位点之间有很好的相互代表性;未发现BsmI-TaqI组成的单体型与MM易感性相关。而FokI-BsmI-ApaI-TaqI可组成9种可能的单体型,C G G T是病例组和对照组中最常见的单体型,病例组的频率(31.1%)低于对照组(45.9%),组间比较差异有统计学意义(P=0.044),OR为0.544,95%CI为0.310~0.988,可能为MM的保护性单体型;C A T C单体型在病例组的频率(4.6%)明显高于对照组(0%),组间比较差异有统计学意义(P=0.004),可能为MM的易感单体型。5、1例MM病人同时出现两种北京汉族人群和日本人群罕见的基因型(BsmI AA基因型和TaqI CC基因型)。6、1例MM病人存在VDR基因cDNA1421位点CA杂合型(ATC→ATA,均编码异亮氨酸,位于9号外显子内),对照组未发现,经NCBI证实为同义突变。7、MM患者还存在rs11574113G>C、rs2229829C>A.、rs201747972C>T多态位点,与FokI、BsmI、ApaI、TaqI位点相同,都与无义介导的mRNA降解(NMD)相关。结论:1、VDR基因多态性可作为潜在评估MM患病风险的分子标记。2、FokI、BsmI、ApaI、TaqI多态性在不同种族人群中分布各异,福建地区人群基因频率与所报道的汉族北京人群无统计学差异,部分与日本人群、欧洲人群、非洲人群有统计学差异。3、新发现MM患者存在VDR基因9号外显子区域cDNA1421位点(ATC→ATA)同义突变以及罕见的基因型和等位基因。4、NMD可能与MM发病相关。
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