胆管癌细胞RBE中筛选fascin基因下游信号分子的研究

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目的从全基因组水平探究,在胆管癌细胞RBE中,fascin基因是如何通过下游信号分子促进胆管癌的发生发展。方法应用Affymetrix基因表达谱芯片,将实验分为两组,RNA干扰沉默fascin基因组和未干扰组,比较人胆管癌RBE细胞fascin的下游基因表达谱差异,筛选出有显著表达差异的基因;应用生物信息学软件对差异基因进行Pathway分析和Gene Ontology分析,获得初步的相关筛选结果。结果fascin基因RNA干扰组和未干扰组RBE细胞的基因表达谱比较,筛选出704个基因有显著表达差异,其中466个基因在RNA干扰组RBE细胞中表达下调,238个基因在RNA干扰组RBE细胞中表达上调。进一步分析发现,在肿瘤研究中已发表跟肿瘤发生发展相关的基因FGF-2、PDCD4和ATF3等在我们的芯片差异基因中出现。结论1、FGF-2可能是fascin基因促进胆管癌发生发展的下游功能信号分子之一2、PDCD4可能是fascin基因促进胆管癌发生发展的下游功能信号分子之一3、ATF3可能是fascin基因促进胆管癌发生发展的下游功能信号分子之一
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