干旱(drought)一直是制约全球农业生产的重要因素之一,而培育抗旱植物品种是应对干旱的有效手段。分子标记关联分析(association analysis)是了解表型变异与遗传多态性关系的有效方法,已成为分子育种的重要手段。光合作用(photosynthesis)是植物响应干旱胁迫的较为敏感的指标之一,因此,研究干旱胁迫下的光合特性及其与分子标记关联分析,是挖掘、选育抗旱材料的有效途径。本研究以77份来源不同的白三叶材料为研究对象,通过模拟干旱胁迫下主要光合指标的分析比较,对其光合响应特征及抗旱能力进行评价;将各干旱光合指标与SSR分子标记结果进行关联分析,筛选与抗旱相关的分子标记位点。得到以下主要结果:1.干旱胁迫处理后白三叶的净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、胞间CO2浓度(Ci)和蒸腾速率(Tr)极显著降低(P<0.01)。4个光合指标中,Gs的下降幅度最大,胁迫处理组比对照组平均下降66.3%。Ci的变化最小,胁迫处理比对照组平均低31.7%。干旱胁迫后参试材料间的Pn、Gs、Ci和Tr差异极显著(P<0.01)。以Pn为例,胁迫处理后77份材料的下降幅度范围为4.3%~89.4%。2.基于4个光合指标抗旱指数的综合抗旱评价发现,77份材料的抗旱能力差异显著(P<0.05)。其中,HZMCY932、HYZMC623、HZMC1235等的综合抗旱系数高,抗旱能力强,而白01044、白01176、白01232等对干旱胁迫极其敏感,耐旱能力差。采用系统聚类法将参试的77份材料分为5个大类:干旱极敏感型、干旱敏感型、中抗型、耐旱型和极耐旱型。3.利用Structure2.3.4软件,参试材料被分为3个亚群。通过GLM和MLM两种模型,共检测到与白三叶抗旱性光合指标相关联的分子标记有52个,共有86次显著关联(P≤0.05)。同时被两种模型检测到的SSR位点是47个,累计发生4次显著关联(P≤0.05)。其中,有21个SSR分子标记同时与2个或多个相对光合指标显著关联。gtrs370、gtrs613和gtrs931同时与4个光合指标相关联。