随着人类文明的不断发展,不同于传统一般制造企业,以科学技术为主要生产核心的相关高新技术企业,在全球经济以科学技术为主要发展动力的当前时代背景下衍生,为保证高新技术企业拥有更多的发展机会与市场平台保驾护航,除却国家政务陆续出台的一系列优惠支持举措,高新技术企业启用绩效评价系统对于企业经营发展进行实时监控。本文首先通过对于现有国内外高新技术企业绩效评价体系调查发现,相对于西方欧美国家而言,我国内部高新技术产业起步较晚,存在着无法忽视的滞后性。大部分高新技术企业依旧沿用传统制造企业的绩效评价系统,单一重视财务层面指标的变化对于企业所带来的影响。然而区别于传统制造企业的高投入、高风险、高创新等特点,仅仅通过财务层面指标无法全面有效的对于高新技术企业绩效进行精准评价。面对如此情况,制定出一套以高新技术企业为主要使用者,融合企业特征以及战略发展需求的绩效评价体系,是保证我国高新技术企业良好发展环境的必要手段。通过进一步研究发现作为一个发展成熟同时兼备战略管理以及绩效管理的评价工具,平衡计分卡可以很好匹配高新技术企业的自身特点,足以达成准确、全面、客观的高新技术企业的绩效评价要求。进一步剖析我国高新技术企业存在的问题与不足,对于高新技术企业的特征点以及现行绩效评价模式进行调查,分解影响企业绩效评价的关键要素。阐述使用绩效管理工具—平衡计分卡的基本作用原理,综合其原有使用经验,避开在以往绩效管理中存在的使用误区。验证平衡计分卡在高新技术企业的使用匹配率,结合企业高精尖技术密集等特点,列举应注意事项问题的同时,构建财务、客户、内部路程、与学习与成长四个方面的绩效评价体系。选用代表性研究企业Y公司,经过对于Y公司概况、经营模式、现有绩效评价体系的研究,通过变异系数、灰色关联度与功效函数等分析方法,对以研究对象Y公司特点而定制的平衡计分卡绩效体系的结果进行评价,根据评价结果提出企业现阶段问题,靶向性提出改进建议的同时,总结由于研究对象单一导致的评价研究不够透彻,存在一定的不完善性。需要在以后加深学习与研究,深化平衡计分卡在高新技术企业领域的使用。