内部资本市场是企业总部对企业内部资源进行整合和重新配置的场所，内部资本市场的效率性研究一直是理论界和学术界广泛关注的议题。但是国内外学者在对内部资本市场资源配置效率进行研究时，都把控制链局限于上市公司的控股股东，而研究发现在全世界大多数的上市公司中，都存在着终极控制人现象，由于终极控制人能够对公司施加重大影响，并且以少数股权的特殊方式，这就使研究终极控制人的内部资本市场行为进而更全面反映企业的内部资源配置成为必要。　　 本文在对终极控制人及内部本市场相关研究进行回顾和综述的基础上，理论分析了终极控制人在内部资本市场的运作机理，并运用委托—代理理论、交易成本理论等基础理论，分析了终极控制人对内部资本市资源配置效率的影响效应。金字塔股权结构是终极控制人进行内部资本市场运作的组织载体，剩余控制权则是终极控制人采取内部资本市场行为的行动载体，同时也是终极控制人和内部资本市场资源配置效率联系的最核心联结点，终极控制人由于其对上市公司直接和间接拥有的股份而获取了现金流权和控制权，而又由于终极控制人的现金流权和控制权存在偏离，与这个偏离相对应，终极控制人就有着强烈动机获取剩余控制权。本文首次把终极控制人的内部资本市场行为分为契约性行为和非契约性行为，终极控制人就是通过这两种行为在内部资本市场获取剩余控制权，这两种行为也对内部资本市场资源配置效率产生了正向和负向两种效应。　　 本文采用我国沪深两市A股2006年度上市公司作为研究样本，运用最小二乘估计法，实证分析了终极控制人相关特征对内部资本市场资源配置效率的影响，得出以下结论：金字塔股权结构控制下的我国上市公司的内部资本市场资源配置行为相对无效，上市公司资金被占用的情况还比较普遍。我国上市公司终极控制人现金流权和内部资本市场资源配置效率之间呈弱的正相关关系；终极控制人控制权与内部资本市场资源配置效率呈显著的倒U型关系，拐点发生在控制权为52.44％时；终极控制人两权分离度值SR2（终极控制人现金流权/内部董事比率）与内部资本市场资源配置效率存在显著正相关关系：终极控制人的国有性质与内部资本市场资源配置效率呈负相关关系。