乙型肝炎病毒基因结构异质性与宫内感染关系的探究

来源 :山西医科大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:dennaxu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的HBV宫内感染的发生主要与病毒本身、母体和胎儿的免疫状况、胎儿的易感性、及胎盘因素等有关。而HBV感染的患者体内存在着不同的HBV病毒株,呈现“相似株”的现象,即一异质性群体。国内学者倾向于从研究病毒如何突破胎盘屏障入手来探讨宫内传播的机制,但对于乙肝病毒本身的结构及其突变所造成的编码产物不同是否影响宫内传播的研究不够系统。介于宫内传播确切的传播机制仍不很清楚,因而有必要从HBV基因结构入手,着眼于这一异质性群体,运用了分子生物学的技术方法,结合临床流行病学的资料,分析HBV基因的变异,以及变异所带来翻译产物的不同来初步筛选可能与宫内感染有关的特异性基因结构,探讨HBV基因异质性与宫内感染的可能关系,从而为阻断HBV的宫内传播提供有效的理论依据。方法①收集2001年11月~2009年7月于太原市第三人民医院足月分娩的1622例HBsAg阳性孕妇及其新生儿外周血,剔除母儿血清缺失,筛选其中HBsAg和HBV DNA均阳性孕妇且其新生儿HBV DNA阳性的母婴对,共22对。根据克隆测序的要求(HBV DNA拷贝数≥105),最终筛选8对母婴对作为宫内感染组,同期收集HBsAg和HBV DNA均阳性母亲但其新生儿HBV DNA阴性的8例母亲纳入宫内未感染组。②提取血清中HBV DNA,分别扩增宫内感染组8对母婴和未感染组8例母亲HBV DNA前S/S区1.2kb基因片段及前C/C区909bp基因片段,经PCR产物纯化后克隆入pUCm—T载体,最后经PCR酶切鉴定、测序,共得到宫内感染组6对母婴、宫内末感染组3例母亲前S/S区86株HBV序列及宫内感染组6对母婴、宫内末感染组3例母亲前C/C区67株HBV序列,采用Lasergene中Megalin功能对测序结果较好的82株HBV前S/S基因及67株HBV前C/C基因全部序列进行分析,确定基因型并构建种系进化树,比较宫内感染组前S/S区核苷酸序列与各基因亚型标准序列的相似率。③比较发生宫内感染的6对母婴间前S/S区基因相似性的高低以及种系进化关系;比较母亲和婴儿间各克隆株的相似率,并判断相似率的高低;最后比较6对母婴间前S/S区及前C/C区HBV序列间基因位点的不同。④分别比较宫内感染组母亲和未感染组母亲、宫内感染组新生儿和未感染组母亲之间核苷酸序列的差异。⑤比较不同基因型的宫内感染率,进而分析HBV基因型与宫内感染的关系;并比较HBV核什酸序列的差异和宫内感染的关系。结果①从6例新生儿(NA-NF)血清中分别扩增得到1.2kb和909bpDNA片段,同时从该6例新生儿的HBsAg和HBV DNA均阳性母亲(MA-MF)血清中扩增得到1.2kb和909bpDNA片段。此外,从同期新生儿未感染的3例HBV DNA阳性母亲(I、J、K)血清中也扩增到1.2kb和909bpDNA片段。②用79株HBV序列的前S/S区和GenBank中A~F基因亚型标准序列的前S/S区构建HBV的种系进化树,并同时用每例样本的各克隆株共82株克隆株与GenBank中A~F基因亚型标准序列的前S/S区构建HBV的种系进化树,其中74株HBV克隆株与C基因亚型的标准序列进化距离最近,宫内感染组母亲的65株克隆株前S/S区的所有核苷酸序列与M12906的相似率最高,平均为96.25%,与A、B、D、E、F基因亚型标准序列的平均相似率分别为91.32%、91.46%、88.45%、87.22%、85.43%,与6个基因亚型间的相似率存在差别(F=98.944,P=0.00)。③将前S/S区的82株核苷酸序列及前C/C区的66株核苷酸序列分别与C基因型的标准序列进行比较,得到每一株克隆序列的相似率,然后求得平均相似率分别为96.5%、98.32%,经t检验分析得此两基因区的核苷酸相似率存在差别(t=-3.096,p=0.007),且核苷酸相似率以前C/C区高于前S/S区。④发生宫内感染的6对母婴HBV前S/S区序列中,每一例新生儿HBV克隆株间的平均差异率各为99.83%、99.83%、99.10%、99.51%、99.61%、96.52%,每一例母亲HBV株的平均差异率分别为99.05%、99.04%、99.39%、99.39%、99.47%、94.69%,新生儿HBVDNA的相似性高于母亲(t=2.119,p=0.088);前S/S区各母婴对间HBV序列间平均相似率分别为98.81%、99.29%、99.28%、99.45%、99.52%、95.61%母婴HBV序列间一致性较高。分别以每一对母婴核苷酸序列的前S/S区构建种系进化树,可以看出每一对母婴序列间的进化距离都比较小,分别为0.9、2.9、1.2、0.7、0.7、4.9,表明发生宫内传播母婴体内HBV间的进化距离较小,亲缘关系比较接近。且发生宫内传播的母婴序列中,母体内的优势株和新生儿体内的优势株是不完全一样的。其中,MA的优势株在NA中没有检到,ME的弱势株成为NE中的优势株,MB和MD的优势株在新生儿体内出现的频率高。同时发现“a”抗原决定簇(nt524~nt595)内的两个基因位点nt529和nt531发生突变。⑤通过对携带各种HBV基因型的孕妇发生宫内感染的情况分析可得,携带HBVC型孕妇共48例其宫内感染率为64.6%,携带HBV B型孕妇3例其宫内感染率为100%,C型与B型的宫内感染率经统计学检验尚不能认为两者差别(χ2=0.427,p=0.513)。⑥通过对宫内感染组新生儿,宫内感染组母亲和未感染组HBVDNA阳性母亲序列的比较,可以看出克隆株间差异率从未感染组母亲、宫内感染组母亲到宫内感染组新生儿呈现递增的趋势,且其差别具有统计学意义(Fs=26.389,p<0.000;Fc=5.680,p=0.004),同时每个组内前S/S区基因的核苷酸差异率与前C/C区基因的差异率均有差别。结论①本研究共得到前S/S区86条克隆株,在判断基因型别及研究相似率及差异率时剔除了7条测序效果不好影响分析结果的克隆株,最终得到82株克隆株,分析得其中74株属于C基因亚型,8株属于B基因亚型,故可以得出太原地区HBsAg和HBV DNA均阳性的孕妇及新生儿携带HBV基因型以C型为主,B型较少,这一分布符合我国HBV基因型的流行病学空间分布特点。②对发生HBV宫内感染的6例新生儿及其母亲HBV克隆序列间进行种系进化分析,比较序列间相似性和差异性且序列间的变异位点,得到母婴序列间具有同源性并支持了HBV由母体向新生儿的传播方向。且由结果可知:母体内HBV异质性群体中不分优势和弱势群,均可以通过宫内传播感染新生儿,单株感染和混合感染均有发生,且母体内和新生儿体内的优势株并不相同,提示HBV的宫内感染存在选择性。③对3例B基因亚型和51例C基因亚型的孕妇宫内感染情况进行分后,发现B型和C型在宫内感染的过程中不存在哪种基因型更具有宫内感染的优势。④前S/S区和前C/C区的宫内感染组内母亲和新生儿以及宫内未感染组的母亲的序列差异性相比较,可以看到在差异率从未感染组母亲、宫内感染组母亲到宫内感染组新生儿呈现递增的趋势,且其差别具有统计学意义(Fs=26.389,p<0.000;Fc=5.680,p=0.004).同时每个组内前S/S区基因的核苷酸差异率与前C/C区基因的差异率均是前S/S区的高于前C/C区,且差异具有统计学意义(p<0.01)。⑤通过分别对宫内感染组母婴间,宫内感染组母亲与未感染组母亲以及宫内感染组婴儿与未感染组母亲间的序列比对,初步筛选出系列的变异位点,这些变异以突变为主间或也有缺失与插入,但总体呈现“杂乱”的现象。但是仍然可以看出前S/S区的突变率高于前C/C区的突变率,且发现了S区“a”抗原决定簇(nt524~nt595)内的两个基因nt529和nt531发生突变。
其他文献
目的探讨复发性浆细胞性乳腺炎再手术的原因、手术时机及手术方法。方法对收治的13例复发性浆细胞性乳腺炎的临床资料进行回顾分析。结果13例患者中7例因乳房脓肿行多次切开
自然拼读法是建立单词音形联系以促进学习者单词拼读能力的一种英语教学方法,目前主要被运用于儿童阶段。本文通过分析大学生英语语音问题,提出将自然拼读法引入大学课堂并与
工科大学生企业实习难是我国高等工程教育中长期没有得到解决的问题,借鉴国外大学生企业实习活动经验有助于改善这一现状。本文以法国工科大学生企业实习为研究对象,围绕政府
摘要:随着新课程改革在教学中的不断深入,多数教师开始在英语课堂上积极地落实新课标理念。在实践的过程中,由于教师对新课标理念的理解不够透彻,课堂活动设计考虑不够周全等原因,往往会走入一些误区,使课堂活动流于形式,课堂效率不高。结合教学实践,谈了提高英语课堂活动效率的几点认识和具体做法。  关键词:课堂活动 目标具体 主导作用 分层教学 教师评价  一、通过教学反思发现问题  初中英语新课程标准指出,
泥质岩的地球化学特征蕴含了大量地质信息,在物源和沉积环境分析中的应用十分广泛。利用X射线荧光光谱仪和电感耦合等离子体质谱仪(ICP-MS)对华北板块南缘焦作煤田石炭—二叠纪
石油作为工业生产重要能源,其生产运输一直都备受关注,为满足实际发展需求,逐渐有更多新型技术被应用其中,建立更为完善的管道系统。就我国石油产业发展现状来看,规模在不断
本文从巴赫金的语境和对话理论入手,分析了翻译的语境系统及翻译的对话本质,以实例分析了翻译中的共时对话、历时对话关系在译本的形成与发展中的作用,提出把握翻译的对话、
广东省药材公司中药饮片厂创建于1990年,是全国中药饮片专业生产企业之一。该厂位于佛山市南海区里水工业区,占地面积2万多平方米,生产厂房、质量检验、仓储和办公等建筑面积3万
最近几年陆续修订的《民事诉讼法》、《消费者权益保护法》、《环境保护法》确立了民事公益诉讼制度,但因民事公益诉讼本土化理论供给匮乏,立法者没有贸然制定民事公益诉讼特
乡村文化是以农民为主体的文化,是乡村居民在长期的生产和生活中创造出来的文化。城镇化进程中,有的地方割裂当地文化甚至以牺牲当地生态环境与乡村文化为代价来力图实现所谓