APOBEC3G基因多态性与慢性乙型肝炎易感性关系的研究

来源 :南方医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yici_00
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究背景:乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus, HBV)感染是全球范围内严重的公共卫生问题之一。据世界卫生组织报道,全球约20亿人具有HBV感染史,其中3.5亿人为慢性感染者。HBV感染是造成慢性肝炎、肝硬化和肝细胞癌的主要原因之一,而且每年有将近100万人由于HBV感染而最终死亡。从80年代中期以来,新发的后天获得性乙型肝炎的数量逐渐在减少,而且乙型肝炎疫苗的成功使用,也降低了急性乙型肝炎和慢性乙型肝炎的发生率。但是,HBV感染仍然是造成肝脏疾病最主要的致病因素之一。现有研究表明,生活环境、病毒特征及其宿主自身素质等方面的差异会造成乙型肝炎出现不同的疾病过程和临床结果,特别是宿主本身的年龄和性别差异或者合并HIV、HCV感染时,对疾病的发展具有相当大的影响。由于宿主的天然免疫在机体抵御HBV感染的过程中非常关键,宿主对HBV的遗传易感性在乙型肝炎发病和预后等方面尤为重要,因此,研究乙型肝炎的宿主遗传易感性具有十分重要的意义。载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽(APOBEC)家族成员,是近年来发现的具有抗病毒作用的天然免疫分子。载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽3G (APOBEC3G)是该家族中的成员之一,又称为CEM15,它具有胞苷脱氨酶活性,诱导病毒基因组发生碱基突变,可使胞嘧啶(C)脱氨基变为尿嘧啶(U),能抑制vif缺陷(△vif)人类免疫缺陷病毒-1及HBV复制。APOBEC3G基因定位于22号染色体长臂22q12-q13.2,含有8个外显子和7个内含子,编码384个氨基酸。现有研究提示,APOBEC3G在人肝癌细胞系HepG2和HuH7中对HBV的复制有抑制作用,慢性HBV感染患者的APOBEC3G表达升高,但有关4POBEC3G基因多态性与慢性乙型肝炎易感性关系的研究目前尚未见报道,为探索APOBEC3G基因多态性与慢性乙型肝炎易感性之间可能的相关性,本研究检测了病例组和对照组中APOBEC3G基因rs185983011和rs5757465两位点的多态性分布,以期确定这两位点的多态性是否同慢性乙型肝炎发病有关。研究目的:1.检测APOBEC3G基因rs185983011和rs5757465两位点在人群中的多态性分布。2.确定rs185983011和rs5757465两位点的基因型和等位基因及其频率的分布情况。3.探讨rs185983011和rs5757465两位点的多态性与慢性乙型肝炎易感性之间的关系。研究方法:1.选取APOBEC3G基因序列最长的第3个外显子作为目标序列。运用Primer Premier5.0软件,在目标基因序列上下游及其内部设计引物,并进行筛选。2.采用病例对照研究的方法。从南方医院感染内科选取159例慢性乙型肝炎患者作为病例组、186例HBsAg和HBeAg皆阴性的个体作为对照组,并分别收集各研究对象的血液样本及其临床资料。运用康为世纪试剂盒提取各自血液样本基因组总DNA。3.应用筛选好的引物对样本基因组总DNA进行PCR扩增,并采取Sanger法对PCR产物进行测序。4.应用Sequencher4.10.1Demo软件对测序结果进行多序列比对,寻找和确定SNP位点。5.应用Hardy-Weinberg遗传平衡定律检验病例组和对照组基因型的平衡情况,并进行比较。6.根据测序成功样本的峰图结果确定位点基因型和等位基因,并计算其频率。运用SPSS13.0对收集的两组样本资料的实验结果进行统计分析,探讨各位点的多态性与慢性乙型肝炎易感性的关系。结果:1.将成功测序的样本结果通过Sequencher4.10.1Demo软件与Genebank人类APOBEC3G标准序列(NCBI Reference Sequence:NM021822.3)进行多序列比对,以及在NCBI dbSNP数据库中进行核对,确定了rs185983011和rs5757465两基因多态性位点。根据峰图判断突变位点的基因型和等位基因,从而得到两位点在检测人群中的多态性分布。2. rs185983011位点的基因型和基因频率:病例组和对照组样本PCR扩增产物测序结果显示,该位点包括C/C和C/T两种基因型,其中以C/C为主(占两组研究对象总数的97.7%)。在病例组中,C/C基因型154例,占96.9%;C/T基因型5例,占3.1%。在对照组中,C/C基因型183例,占98.4%;C/T基因型3例,占1.6%。两组基因型分布运用Fisher确切概率法进行比较,结果差异没有统计学意义(x2=0.888,P=0.478>0.05)。等位基因C、T在病例组中的频率分别是97.5%、2.5%;在对照组中频率分别是98.9%、1.1%。运用Fisher确切概率法对两组等位基因频率进行比较,结果差异也没有统计学意义(x2=1.041,P=0.420>0.05)。rs185983011位点的基因型分布和等位基因频率在男性中和女性中、各年龄层中的分布差异均无统计学意义。3.rs5757465位点的基因型和基因频率:病例组和对照组样本PCR产物测序结果显示,该位点包括C/C、C/T和T/T三种基因型。在病例组中,C/C基因型10例,占6.3%;C/T基因型52例,占32.7%,T/T基因型97例,占61.0%。在对照组中,C/C基因型7例,占3.8%;C/T基因型58例,占31.2%,T/T基因型121,占65.0%。对两组基因型频率进行χ2检验,结果差异没有统计学意义(χ2=1.394,P=0.498>0.05)。在病例组中,等位基因C、T的频率分别是16.4%、83.6%。在对照组中,等位基因C、T的频率分别是9.7%、90.3%。对两组等位基因频率进行χ2检验,结果差异没有统计学意义(χ2=3.432,P=0.064>0.05)。rs5757465基因型分布和等位基因频率在男性中与女性中、各年龄层中的分布差异均无统计学意义。结论:1.rs185983011位点在人群中的基因型是C/C和C/T,以C/C为主(占两组研究对象总数的97.7%),rs5757465位点在人群中的出的基因型为C/T和T/T。2.本次研究鉴于rs185983011位点在NCBI的dpSNP数据库的基因多态数据未见报道,首次检测了rs185983011位点在中国人群中的基因型分布只有是C/C(97.7%)和C/T。虽然受样本量和抽样方法所限,该结果可能不具绝对代表性,但还是可为进一步探索和确定APOBECE3G存在于中国人群中的SNP位点及其分布提供一定的依据。3.本研究中,rs185983011和rs5757465两位点的多态性与慢性乙型肝炎不存在相关性。可能由于样本量过小,或者研究过程出现误差造成的,也可能是这两位点多态性确实与慢性乙型肝炎没有相关性。若要进一步证明该研究结果,要考虑进行大规模、大样本、多中心的人群资料流行病学调查。
其他文献
<正> 补中益气汤源自《脾胃论》,乃李东垣根据《内经》“劳者温之,损者益之”和“温能除大热”之原则制定的治疗内伤气虚发热的方剂。笔者在临床上应用此方加减,治疗某些肛肠
本文主要从三个方面对老子“淡”论思想进行研究:首先,从版本学角度爬梳诸多《老子》传世本中“淡”字的使用和书写情况,在澄清“淡”字所出现章节的基础上,从注疏史的角度入手在义理层面对老子之“淡”进行探析。前人主要从“味”、“道”、“心”的角度对老子之“淡”作义理上的疏解,在此基础上,笔者认为还可以从“为”、“言”的角度对老子之“淡”作进一步的阐释。其次,将“淡”这一思想放入老子的整个思想体系中进行考察
空调压缩机电机在高温环境下运行,导致铸铝转子性能衰减明显。本文针对一款5PH工频压缩机和一款20PH变频压缩机,其对应的3.5kW和15kW两款2极三相异步电动机,对比分析铸铜转子
茶树修剪物直接还田是茶园管理中常见的栽培措施。本文通过提取不同处理的土壤样品总DNA,以未处理土壤样品为对照,利用变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE),研究添加茶树修剪物对茶园
在医院药学由传统药品保障供应型向临床药学服务型转变的过程中,药学人才的培养举足轻重。在医院药学发展的新时期,如何充分调动起学生的学习积极性,提升未来药学工作者的综
根据消费的基本理论,对我国农村居民消费倾向变化及其相关影响因素进行理论和实证分析,对我国农村居民消费倾向的发展趋势与影响农村居民消费倾向的主要因素进行总结,并得出
目的:本实验以慢性病毒性肝炎患者肝组织和血清的转化生长因子β1(transforming growth factor β1,TGF-β1)为研究对象,观察肝纤维化不同阶段TGF-β1在肝组织内表达情况及血清水
背景:痰阴转在耐多药结核病患者的监测中发挥重要作用,患者治疗随访过程中的痰菌改变是预测治疗转归的重要指标。定期的痰培养的监测对于早期发现治疗失败的耐多药结核病患者
在当前国家加强长江经济带生态环境保护的政策背景下,流域内自然保护区水电站生态环境问题将全面整改。概述了江西官山国家级自然保护区水电站基本情况,认为水电站建设与运营
分布式光伏发电在我国未来市场具有广阔的发展前景,其具有发电功率低、稳定性强的优点,有利于就近并网用于配电侧的分布接入。其可再生能源综合利用方式不仅可以提高同规模光