结合改进全卷积神经网络和混合水平集方法的三维脑肿瘤图像分割研究

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脑肿瘤是当今神经外科常见的疾病。早期筛查和诊断可极大地提高脑肿瘤患者治愈率、降低病死率。脑部影像学检查方法中,由于核磁共振成像(MRI)具有无放射性损害以及高度的软组织分辨能力等独特优点,已经发展成为用于诊断脑肿瘤疾病的主要方法。由于MRI图像数据量大,并且脑肿瘤形状极其不规则,因此人工分割脑肿瘤非常耗时,而且可能错过微妙的异常。为了提高医生的诊断效率,降低因医生主观因素造成的误诊和漏诊,本文以三维(3D)MRI脑肿瘤图像为研究对象,使用深度学习方法和传统分割方法对全肿瘤、肿瘤核心和增强肿瘤进行全自动且高准确度的分割。主要研究工作如下:
  为了提高3D脑肿瘤图像分割准确性,提出一种结合改进全卷积神经网络(FCNN)和混合水平集方法的3D脑肿瘤图像分割算法。算法首先对T1、T1C、T2和FLAIR四种模态的MRI脑肿瘤图像进行去除偏置场效应和灰度归一化的预处理操作;然后利用级联机制,根据全肿瘤、肿瘤核心和增强肿瘤三类肿瘤结构的位置关系,使用改进的FCNN分别对三类肿瘤结构进行初分割,将多类分割问题简化为三个二元分类任务,同时为了提高分割性能,改进的FCNN采用各向异性卷积核、密集连接和多尺度特征融合,并分别在横断面、冠状面和矢状面方向上进行模型训练,融合三个不同正交视图的分割结果;最后,利用混合水平集方法细化初分割结果中的脑肿瘤边界,完成脑肿瘤精分割。
  为验证本文所提分割算法的优越性,本文针对实验结果进行分析。实验将BRATS2017数据集按照4∶1∶1的比例随机分为训练集、验证集和测试集。实验结果表明:本文所提算法能有效实现3DMRI脑肿瘤图像的分割,且分割准确性高、稳定性强,全肿瘤、肿瘤核心和增强肿瘤分割结果与金标准相比,戴斯相似性系数(Dice)均值分别可达0.9113、0.8581和0.7976。本文提出的结合改进FCNN和混合水平集方法的3D脑肿瘤图像分割算法能够自动、准确地分割出MRI图像中脑肿瘤区域,对临床诊断脑肿瘤疾病具有实用意义。
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