目的：利用荧光原位杂交与免疫组织化学方法检测胃癌组织芯片中Her-2/neu基因扩增及蛋白表达，探讨Her-2/neu和Smad7在胃癌中的表达与胃癌各临床病理特征之间的关系及两者相关性。方法：选取120例胃腺癌组织和50例癌旁组织，采用免疫组化Envision二步法检测Her-2/neu和Smad7在两组中的表达，应用荧光原位杂交检测胃癌组织芯片标本中Her-2/neu基因的扩增情况。结果:120例胃癌组织进行IHC检测,Her-2表达77例显示为不同染色，16例（3+），6例灶性（3+），37例（2+），18例（1+）。阳性率为18.3%。与患者的性别、年龄、民族、淋巴结转移均无相关性（P>0.05）,但与肿瘤发生的部位、分化程度、Laurens分型具有相关性（P<0.05）。 FISH检测41例阳性，扩增率为34.2%。对FISH阳性的5例IHC灶性（3+）标本不同着色强度部位进行对比FISH检测，5例全部扩增。Smad7蛋白101例呈现阳性表达，阳性率为84.16%。胃癌中Her-2/neu表达与Smad7蛋白表达呈正相关，相关系数r=0.277，P=0.002。结论:1.利用组织芯片技术可以简便高效的提高胃癌患者Her-2/neu的阳性率及FISH检测的敏感性。2.胃癌中Her-2的表达与民族不相关，肠型胃癌及胃食管交界处肿瘤患者可能是Herceptin治疗的适用人群。3.Her-2与Smad7的联合评价对判断胃癌患者的预后提供重要价值。