利用蛋白组学挖掘小麦赤霉病抗性相关基因

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赤霉病是一种毁坏性的小麦病害,可导致减产并影响籽粒品质。高通量的蛋白组学技术的发展,使得鉴定抗病相关基因成为可能。由于采用单一基因型为背景材料,前人在小麦与赤霉菌互作蛋白组学方面的研究具有一定的局限性。本研究使用了非标蛋白组学技术,针对混池的小麦穗轴,鉴定了多个基因型背景下四个混合样品池的蛋白表达水平:抗病接种池(RF),抗病对照池(RC),感病接种池(SF)和感病对照池(SC)。比较蛋白组学发现,RF与RC之间有126个差异蛋白,SF与SC之间133个,RF与SF之间115个。通过将鉴定到的所有蛋白比对至中国春参考基因组,同时搜索文献数据库,本研究构建了 17小麦赤霉病一致性抗病QTL(quantitative traitlocus)图谱,并将蛋白映射到这些区间中,共404个蛋白落入对应的QTL区间,其中有38个差异表达蛋白,这些蛋白为克隆相关QTL提供候选基因。本研究利用加权基因共表达网络(Weightedcorrelation network analysis,WGCNA)对蛋白表达数据进行了分析,以期发现与抗、感病关联的核心调控蛋白。结果共构建了 23个蛋白表达模块,蓝色模块中共鉴定了34个与抗、感病相关蛋白,绿宝石色模块中共49个赤霉病响应蛋白。另一方面,通过比对赤霉菌蛋白数据库,本研究鉴定到相关赤霉病菌蛋白,结果发现伸长因子1α和RNA解旋酶FAL1在蛋白互作中具有重要作用,可作为候选基因进行深入研究。本研究是第一个采用小麦穗轴混池的高通量蛋白组学,提供了小麦与赤霉菌互作蛋白组学新的视角。
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