青藏高原具有独特的气候条件和地球化学特征，是研究土壤微生物空间分布特征的天然实验室。但目前对此地区此方面的研究依然较少。以往研究表明表型研究和分子技术研究方法的结合可以更好了土壤微生物种群特征。因此，本研究将传统的涂板技术和现代分子生物学方法（如全基因组测序）相结合来解析青藏高原不同地区土壤细菌群落组成和基因变异特征。首先，基于两种寡营养成分培养基（R2A、SEA（土壤浸提液））试图分离土壤新菌，描述可培养细菌群落组成。结果显示，从58个土壤样品分离得到的382个菌株分属于4个门，42个属，其中大量分离菌株属于广布性已知物种。在门水平上，最优势种群为放线菌门(42％)、其次是厚壁菌门(30％)、变形菌门(22％)和拟杆菌门(6％)。在属水平上，最优势种群为节杆菌(38％)、芽孢杆菌(17％)和类芽孢杆菌(12％)。其次，除个别菌株外，大部分分离得到的菌株并未表现出明显的空间分布模式，表明可培养细菌的空间分布可能并不像高等生物的生物地理分布易于预测。此外，在所有已分离得到的菌株中，可能有两个新种，这表明青藏高原独特的环境条件可能为土壤微生物提供了一个特殊的生态位。目前已运用多相分类鉴定方法确认新物种。最后，进一步对Arthrobacter，Bacillus和Paenibacillus属的细菌进行了全基因组测序，以研究不同菌株之间基因组的变化。结果显示分离得到的各属在基因组水平确实存在显著的遗传变异。