目的评价支气管肺泡灌洗液（BALF）中人矮小同源盒基因（SHOX2）和RAS相关结构域家族1A基因（RASSF1A）甲基化对肺癌的诊断价值。对比分析BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化、BALF液基薄层细胞病理学以及外周血癌胚抗原（CEA）的检测结果,评价这三种方法对肺癌的诊断效能和临床应用价值。方法选择2019年6月～2020年1月在我院呼吸与危重症医学科和胸外科门诊及住院的符合纳入标准的60例患者作为研究对象。支气管镜下收集研究对象的BALF,通过实时荧光定量甲基化特异性PCR（q MSP）测定BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化状态。同时收集肺组织标本驱动基因EGFR、ROS1、ALK、BRAF突变检测结果、BALF中液基薄层细胞病理学和外周血CEA的检测结果。依据组织病理学结果,将研究对象分为肺癌组及非肺癌组,分析BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化、BALF中液基薄层细胞病理学和外周血CEA对肺癌的诊断的灵敏度及特异度,并构建受试者工作特征（ROC）曲线,计算曲线下面积（AUC）以评价不同检测方法对肺癌的诊断效能。使用Spearman相关分析及Fisher确切概率法分析肺癌患者中不同病理类型、TNM分期、影像学特征以及肺组织驱动基因检测与BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化状态的相关性。结果1.BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化诊断肺癌灵敏度为45.5%,特异度为100.0%,具有统计学意义（P<0.05）。BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化诊断肺癌的AUC值为0.727（95%CI:0.598～0.856）,与BALF中液基薄层细胞病理学（AUC值为0.716,95%CI:0.584～0.847）和外周血CEA（AUC值为0.565,95%CI:0.398～0.732）相比,对肺癌的诊断效能更佳。将BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化与BALF中液基薄层细胞病理学以及外周血CEA联合检测时,AUC值可提高至0.813（95%CI:0.706～0.921）,诊断效能进一步提升。2.肺癌组BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化状态与影像学中病灶大小、病灶部位、病灶性质、胸膜增厚、支气管截断征、胸膜凹陷征以及肺气肿之间具有相关性（P<0.05）;按胸部CT病灶直径大小进行分组,病灶直径为1～3 cm以及3～5 cm分组中,BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化对肺癌的灵敏度高于BALF中液基薄层细胞病理学和外周血CEA检测。3.针对进行驱动基因检测的31例非小细胞肺癌（NSCLC）患者基因检测结果分析:EGFR基因突变率为80.6%（25/31）;在BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测阳性患者中,EGFR基因突变率72.7%（8/11）,BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测结果与NSCLC患者驱动基因EGFR突变无相关性（P>0.05）。结论1.BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化在肺癌患者中阳性率明显高于非肺癌患者且特异性高,SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测可辅助鉴别肺部良恶性病变。2.BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化对肺癌有较好的诊断效能,其联合BALF中液基薄层细胞病理学以及外周血CEA检测,可以进一步提高对肺癌的诊断效能。3.针对肺部病灶直径为1～3 cm、3～5 cm的患者,BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测诊断灵敏度优于BALF中液基薄层细胞病理学以及外周血CEA检测。BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化可辅助影像学疑似肺癌患者进一步明确诊断。4.BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测结果与NSCLC患者肺组织驱动基因EGFR突变无相关性。