【摘 要】
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神经退行性疾病是大脑和脊髓的细胞神经元缺失而引起的不可逆转的疾病,病因尚不明确,也无彻底治愈的特效药。近年来病患数量在不断增加,预计2050年全球约有1.52亿神经退行性疾病患者,解决神经退行性疾病的问题迫在眉睫。长期服用西药不仅会带副作用也会产生依赖性,这迫使人们寻找新的方法和途径。然而多项研究表明,中药在治疗神经退行性疾病方面发挥了重要作用。利用中药中的天然产物开发新药对治疗神经退行性疾病具有
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神经退行性疾病是大脑和脊髓的细胞神经元缺失而引起的不可逆转的疾病,病因尚不明确,也无彻底治愈的特效药。近年来病患数量在不断增加,预计2050年全球约有1.52亿神经退行性疾病患者,解决神经退行性疾病的问题迫在眉睫。长期服用西药不仅会带副作用也会产生依赖性,这迫使人们寻找新的方法和途径。然而多项研究表明,中药在治疗神经退行性疾病方面发挥了重要作用。利用中药中的天然产物开发新药对治疗神经退行性疾病具有重要意义。法卡林二醇(falcarindiol)是一种天然的聚乙炔醇化合物,已证明具有抗炎、影响神经功能和潜在的抗癌特性。GABAA受体是重要的神经类受体也是许多神经类药物的作用靶点。例如镇静剂、麻醉剂、抗癫痫药物等都可以作用于GABAA受体。研究表明,法卡林二醇对GABAA受体有一定的调节作用,效果如何目前未知。在此背景下,我们通过计算模拟研究人体GABAA受体(亚基组成为α1β2γ2)和法卡林二醇的相互作用机制。我们对研究的设想如下:1)确定法卡林二醇在GABAA受体上稳定结合的位点。2)法卡林二醇在结合位点如何调节GABAA受体,激活作用还是拮抗作用?因此对GABAA受体进行位点预测和分子对接后,得到7个位点复合物先进行了常规分子动力学模拟,法卡林二醇与受体在7个位点的结合自由能计算,通过伞形采样模拟确定不同位点所起的作用,后续又对法卡林二醇如何影响GABA分子结合GABAA受体,GABAA受体构象变化等进行分析。结果表明:1)通过结合自由能计算后,我们确定法卡林二醇在受体上结合稳定的6个位点。2)伞形采样模拟结果得到法卡林二醇在6个位点都使氯离子通过通道的能量值高于单独GABAA蛋白的情况。这说明法卡林二醇存在时不利于氯离子进入细胞内起到拮抗作用。3)法卡林二醇存在时GABA分子在200ns内都相继脱离了受体,β亚基loop C上残基SER201的CA原子和α亚基上残基LEU128的CA原子间距离随时间变大。说明了法卡林二醇的存在不利于GABA分子与受体结合起到拮抗作用。4)从构象变化上看到跨膜螺旋发生顺时针旋转,而受体激活剂通常会使螺旋发生逆时针转动通道有打开的趋势。说明法卡林二醇没有使通道趋向开放的状态进而起到拮抗作用。螺旋的顺时针转动及氨基酸残基曲率变化都揭示了跨膜区位点的法卡林二醇使螺旋亚基之间发生驱动,进而带动胞外区亚基顺时针转动,β亚基上loop C呈打开趋势。总之,我们通过分子动力学模拟和相应的分析方法,确定了法卡林二醇在GABAA受体上结合稳定的位点,并且这些位点均对受体产生拮抗作用,最终得到三个有效位点在跨膜结构域。将为后续研究聚乙炔醇类化合物对GABAA受体作用及相应药物开发提供理论依据。
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