基因调控网络的线性回归模型及其鲁棒性分析

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基因调控网络(Gene Regulatory Networks,GRN)是表示基因之间复杂的调控关系的网络,基因间相互的调控关系影响着生物体的各种生理活动和动作。基因调控网络的研究从基因间的相互作用出发,揭示了生物体复杂生命现象的本质,是基因功能组学的重要内容。对基因调控网络的研究具有重要的理论和实际应用意义,已经成为当前生物信息学研究的热点问题之一。  本文主要研究基于线性模型的基因调控网络的构建。首先对线性模型构建基因调控网络的可行性进行了研究,为了查看基因表达数据之间是否具有线性关系,本文采用PCA方法对 RAF数据集进行了一个深入的研究。其次,采用基于LARS算法获得 Lasso解的方法构建线性的基因调控网络。最后,对于线性模型构建基因调控网络的方法进行了鲁棒性分析,分别从噪声、数据缺失和样本减少三个方面对其进行了深入的探讨。
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