目前,人们对癌基因(蛋白)的相关功能及生物学通路的认识还比较有限,限制了癌症的研究进展。因此,出现了许多利用基因表达与蛋白质互作等关系来预测基因与蛋白质功能的算法。然而,目前的算法都将焦点放在功能完全未知的蛋白质上。事实上,很多已注释的癌蛋白的功能知识还很粗泛,因此进一步探索这些癌蛋白的细致功能对探索癌症的发病机制具有重要的意义。对于已知部分功能的癌蛋白,我们提出了一种结合Gene Ontology功能先验知识和蛋白质互作,通过构建功能特异的局部互作网络来挖掘癌蛋白的细致功能的方法。在构建的功能特异的互作网络中,我们以较高的精确率和覆盖率将GO中已知部分功能的蛋白质预测到了更为精细的功能类中。作为应用,预测了口腔癌、肺癌、结肠癌等相关癌蛋白的细致功能。虽然癌症是一种高度异质的复杂疾病,其发生发展涉及到不同的癌基因,但最终癌蛋白都可能通过改变一些共同的重要功能类而影响癌的发展。在本工作中,我们进一步扩展先前构建的功能特异的局部互作网络中的蛋白质相互作用数据,将新的蛋白质预测到了癌相关功能类中,使得与癌症功能密切相关的蛋白质互作子网更加完整。