河流水系是城市生态系统的稀缺资源，同时又是城市的生命之源、活力之源，随着城市化的不断发展，我国城市河流普遍出现水污染与生态退化等问题。城市河流管理也经历了从单纯的水污染防治到水环境治理、水生态修复的转变。我国许多城市都以维护河流生态功能为目的对城市内部河流进行了河流生态修复。但是这些工程建设大多是根据设计人员自己对生态河流的理解来进行的，缺乏一定的规范标准，因此不具有普遍性。本文针对城市生态系统的特点，运用城市生态学理论，对城市河流进行功能区划，使得水管理者可以对具有同样生态特征和资源属性的城市河流进行统一管理，并制定相应的管理标准，确定监测的参考条件及恢复目标，采取切实可行的管理对策和恢复措施。 本文建立了以河流水生态健康状况、水资源脆弱性和水生态服务功能重要性为子系统的水生态功能区划的评估体系，并以层次分析法和GIS技术为基础，建立了城市河流生态功能区划的方法。将城市河流分为水生态资源涵养区、水资源利用保护区、景观生态协调区三大类。 利用本文建立的河流生态功能区划方法，对淮安市城市河流进行了水生态功能区划。在进行城市河流健康评价、水资源脆弱性评价、河流生态系统服务功能评价结果的基础上，将淮安市河流划分为三个大区七个小区。对不同分区的河流生态环境状况、存在的主要问题及原因进行分析，提出了与其相适合的河流生态环境修复保护对策、建议。