榨菜SSR遗传图谱的构建及瘤状茎膨大性状的QTL定位

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wenshengfang1985
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榨菜(Brassica juncea (L.) Czern. et Coss. var. tumida Tsen et Lee)在分类学上称为茎瘤芥,是以膨大的肉质瘤状茎为主要产品器官的十字花科芸薹属芥菜类蔬菜。目前对榨菜瘤状茎膨大性状的研究主要集中在环境调控和细胞相关基因的分子调控上,对其膨大性状的遗传规律及控制瘤状茎膨大性状的基因定位方面的研究,才刚刚起步。本研究利用榨菜转录组序列,开发EST-SSR分子标记;以榨菜(茎膨大)和分蘖芥(茎不膨大)为亲本,通过杂交获得F2代并构建作图群体,利用SSR分子标记构建遗传图谱;并利用该图谱对榨菜瘤状茎的膨大性状进行QTL定位。主要结果如下:(1)利用转录组测序得到的榨菜EST序列信息,运用SSRLocator I vs.1软件进行SSR位点扫描和SSR引物设计,共搜索得到8777个SSRs,并成功地对其中的6127个SSR位点进行了引物设计。将引物设计成功的SSR标记按序命名成BjSSR0001-BjSSR6127,并验证了开发得到的SSR标记具有良好的通用性。(2)以茎膨大的榨菜和茎不膨大的分蘖芥菜为亲本,通过杂交获得的F2代构建作图群体,利用开发的EST-SSR分子标记构建了一张由116个SSR分子标记组成,平均图距为17.92cM,覆盖基因组长度为2061.0cM,包含17个连锁群的芥菜遗传图谱。(3)采用复合区间作图法对控制榨菜瘤状茎膨大的3个性状茎重、横径及纵径进行了QTL定位。检测到4个控制茎重的QTL位点(SWl-4),其中2个位于LG3上,2个位于LG13上,其表型贡献率都较大(均>20%,),可能均为主效基因,其加性效应均为负值。而检测到的控制横径性状的QTL位点(SD)位于标记数最多、遗传图距最长的LG1上,其贡献率为6.54%,与侧连标记的图距最小(0.99cM),加性效应也为负值。未检测到控制瘤状茎纵径性状的有效QTL位点。
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