在建设“创新型国家”的战略目标指引下，为扶植作为技术创新主体的中小企业迅速发展，充分发挥财政资金的杠杆放大效应，我国开始设立创业投资引导基金。经过几年的运作，创业投资引导基金取得了良好效果。但是，由于创业投资引导基金的运作时间较短，有些问题越来越突出。例如创业投资引导基金操作主体能力不足；各方参与人的目标冲突；投资方向混乱；利益分配及激励监管机制不完善等复杂的委托代理问题。如何组建、管理创业投资引导基金、提高政府对引导资金的使用效率是摆在我国政府面前的重要课题。在这一背景下，分析政府创业投资引导基金管理中复杂的委托代理关系和性质，考查创业投资引导基金运作过程中的各方参与人的行为特征势在必行。本文借助复杂性和复杂系统理论、委托代理理论、共同代理理论等，综合使用理论研究、模型构建、实证分析等方法，创新性的从复杂系统角度研究创业投资引导基金委托代理机制，提出创业投资引导基金委托代理系统这一概念。基于系统的角度构建了创业投资引导基金内部管理委托代理模型，得出了内部管理委托代理机制，并为我国当前引导基金管理模式提出完善建议；同时构建了系统的核心节点要素多任务创业投资机构委托代理模型，得出多任务创业投资机构的委托代理机制。此外，还以浙江省创业投资引导基金为例进行分析，为创业投资引导基金的实践运作提供理论支撑。通过研究，本文获得了以下研究成果和研究结论。（1）创业投资引导基金运作具有复杂系统的特征，例如多方参与主体的整体呈现性，结构、目标及时间上的多层次性，与外界环境联系并交换的开放性、动态适应各种变化性质、为应对变化而具有的自组织性等，构成了创业投资引导基金委托代理系统。此系统的节点要素是政府、引导基金管理机构、社会投资者、创业投资机构、创业企业五方参与主体，并且都是系统不可或缺的；节点要素之间的连接是复杂的委托代理关系；各节点元素有极强的“责任意识”，各自的行为选择要以达到系统的整体目标——促进高新技术产业及中小创业企业发展为原则；能对外界的变化做出反应，具有动态适应性和自组织性。（2）在创业投资引导基金委托代理系统的背景下，要以实现系统整体性目标为原则，设计合理的创业投资引导基金内部管理委托代理机制。本文构建了对称条件下和不对称条件下的引导基金管理机构激励机制模型。通过分析模型得出：在对称条件下，政府只要支付给引导基金管理机构合理的工资，使得引导基金管理机构努力的边际收益等于其边际成本，就会促使引导基金管理机构采取最优努力水平；在不对称条件下，要对引导基金管理机构形成固定报酬和浮动激励报酬相结合的薪酬激励机制，最优薪酬激励合同中的激励强度受到引导基金管理机构的专业能力、绝对风险规避程度、努力成本系数、创投机构的收益方差、政策性投资限制等因素的影响。具体来说，当政策性限制较少，对于专业水平较高的、富有冒险精神的、处于较为稳定环境中的、努力成本较低的引导基金管理机构可提高激励强度，使其积极工作，获得最大化收益。（3）本文从复杂系统的角度，对我国创业投资引导基金内部管理模式提出改进意见。指出无论是直接管理模式还是委托社会机构管理模式都应以实现系统的整体性目标——促进高新技术产业及中小创业企业发展为原则，设计引导基金管理机构的激励机制时要因地制宜、因情制宜，并在激励和保险之间求得平衡。其中，实行事业性质单位管理模式的创业投资引导基金，要形成固定报酬和浮动激励报酬相结合的薪酬激励机制，以防止代理人不努力和寻租行为发生；对实行国有公司管理模式的创业投资引导基金，要注意掌握和调整设立方式、收益分配方式，对国有公司施以必要的约束和监管，以防止忽略“政策性策略”行为发生；实行委托社会机构管理的创业投资引导基金，要根据具体情况确定不同的激励强度，并保证激励强度所在区间为（0,1），以防止严重的委托代理问题出现。（4）创业投资机构有投资政策扶植企业和投资高收益性企业双重替代性任务，通过构建投资者与多任务创业投资机构的委托代理模型可得：两种任务的替代性弱化了多任务报酬机制的激励效果。同样的激励程度，会使创业投资机构降低对可观测度低的任务——投资政策扶植企业任务的努力水平，也即创业投资引导基金的“政策性目标”常被忽视。通过弱化创业投资机构的任务替代性，或将创业投资机构的替代关系任务变为互补关系任务，对达成系统整体性目标有极大的促进作用。（5）本文从有利于创业投资引导基金委托代理系统有序运行的角度，基于弱化创业投资机构的任务替代性，或将创业投资机构的替代关系任务变为互补关系任务的原则，提出多任务的创业投资机构委托代理机制。具体包括：优质投资项目的识别与培育机制、具有产业特色的创投机构遴选机制、资金分期到位的参股约束机制、客观和主观方法相结合的多任务创投机构绩效评价机制、合理的多任务创投机构监管机制以及多任务创投机构声誉机制。