【目的】Fas/FasL系统介导的细胞凋亡存在于哺乳动物的多种组织中，参与外周自身反应性T细胞克隆的删除，抗原诱导活化的T细胞的凋亡，细胞毒性T细胞的细胞毒作用，免疫赦免现象及肿瘤的免疫逃逸机制，雌性动物生殖器官的周期性重塑等，具有重要的生理功能，为了进一步理解Fas/FasL系统，本研究拟克隆牦牛Fas和FasL基因，并进行相关的生物信息学分析，且对两个基因在牦牛各组织器官中的表达进行研究。【方法】基于黄牛的Fas和FasL基因的cDNA序列设计引物，通过RT-PCR方法克隆牦牛的Fas和FasL基因序列，通过相关软件及网络资源对目的基因进行生物信息学分析，并结合RT-PCR方法和免疫组化方法，对Fas和FasL基因在牦牛各组织器官中的表达进行检测。【结果】克隆得到了2605bp的牦牛Fas基因cDNA序列，包含完整的开放阅读框序列，编码一段长323个氨基酸残基的蛋白质序列；推导的蛋白质序列在氨基端有一段长22个氨基酸残基的信号肽序列，中间有一段20个氨基酸的跨膜区，将整个蛋白分成胞外区和胞质区，胞外区主要由无规卷曲与延伸链组成，胞内区最后约100个氨基酸残基形成α-螺旋区域。克隆得到了1572bp的牦牛FasL基因序列，包含114bp的5’非翻译区，831bp的编码区和627bp的3’非翻译区；牦牛FasL基因的编码区编码277个氨基酸，羧基端179个氨基酸残基在胞外，氨基端75个氨基酸残基在胞内，跨膜区含23个氨基酸残基，无信号肽序列。同源性分析发现两个基因与其它物种的相应序列有很高的同源性。RT-PCR分析显示除了在心脏中只检测到Fas mRNA外，Fas和FasL mRNA共同表达于所有检测的组织中，且两个基因均在肝脏、脾脏、肾脏、淋巴结、胸腺、睾丸和胎盘突中强表达。免疫组化检测发现FasL蛋白在多种细胞的胞质中表达。【结论】Fas和FasL在进化中较为保守。Fas和FasL共同表达于牦牛的各种器官，且两个基因相关表达，即Fas在某一器官中强表达时，FasL的也强表，反之亦然。FasL蛋白在牦牛的肝脏和肾脏中都强表达，而这两个器官既非淋巴性也非免疫赦免位点，提示Fas/FasL系统还有更为复杂的功能。FasL蛋白存在于牦牛多种细胞的胞质中，该形式的Fasl的功能及作用机理需进一步研究。