近年来中国迅速崛起,综合国力稳步提升,但中国的崛起在日本的认知角度来讲是挑战大于机遇。中日之间历史瓜葛与地缘矛盾交互,其中,南海问题一直是中日关系中的重大议题,日本虽然并非南海问题的当事国,但对南海地区的介入由来已久。南海对于中日两国而言,是集聚了多重利益的重要区域,也是日本对外政策的重要一环。冷战结束至2009年,日本在南海问题上更多是以中立旁观者和斡旋者的身份出现,其行动较为谨慎和克制。但在2009年以后,中国综合国力和地区影响力赶超日本,在东亚国际格局中的重要性开始凸显,日本的南海政策也随其对中国关注度的增加而开始发生重大调整,对中国南海事务的干预力度不断增大,日本介入南海的最根本目标就是要限制中国在南海地区的影响力和行动力,日本在南海问题上的角色定位更像是一个区域之外的搅局者。在国内,日本不断挣脱制度束缚,竭力修改宪法和自卫队法;在国际上,积极配合美国在南海地区的行动,利用外交场合和国际舆论扩大影响力,不断加深与南海地区相关各国的合作。而日本这种政策调整背后的动因引人深思,值得我们深入讨论。新古典现实主义将体系层次与国内层次相结合,能够更好地分析一国外交政策转变的动因。本文以“新古典现实主义”为分析视角,将亚太格局变动、中美日三边关系以及东盟及相关国家政策转变作为自变量,将国家-社会关系（包括大众认知及政治右倾化及民族主义）、领导人意象（领导人性格和领导人对国家利益的认知）作为中介变量,通过对2009年前后日本南海政策的调整和发展进行梳理和分析,以分析“自变量输入国内之后,在中介变量干预下所产生的政策调整”这一思路为主线来分析日本南海政策转变的动因。探讨日本南海政策调整的背后动因,有助于更好地理解日本的这种外交行为所造成的影响,接下来本文从对日本国内、中国以及国际为角度分析了日本南海政策的转变造成的影响。对于国内而言,这种转变不仅会加强日本国内右倾化的程度,而且会促使其外交政策的进攻性越来越强,也会对日本国内财政造成相当程度的负担;对于中国而言,这种转变让中国面临更为严峻的地区环境,对维护南海地区合法权益制造障碍,消耗中国的战略资源;对于国际而言,会使东亚地区海洋局势变得紧张和复杂化,使东盟一体化进程受到阻碍。文章的结论部分以前文分析的多层次动因为出发点,认为新时代中国要正确处理中日关系及南海地区事务应当建立新型对话机制,并透过该机制围绕南海的相关问题从国际、国内两个层次中的多个角度加以沟通,进行总体上的管控。此外,也要持续深化人文交流,夯实两国关系社会基础,改善双方认知。唯有如此,才能构建契合新时代要求的中日关系。