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多基因谱系分析是研究微生物群体遗传的一种有效方法,它具有稳定、直观、可靠、可重复性强等特点,已广泛应用于真菌群体遗传多样性、种群自然繁殖方式的研究中。本研究利用多基因谱系分析方法对松乳菇(Lactarius delicious)自然种群的群体遗传特性进行分析,分析了同一地区或不同地区菌株之间和种群之间的遗传变异方式和规律,阐明了松乳菇的主要自然种群繁殖方式。主要结果如下：(1)利用ITS序列构建系统发育树进行系统分析,并结合子实体及孢子的形态特征对湖南省各地松林中分布最多的4种松菌(CSUFTHH1、CSUFTHH2、CSUFTZJ和CSUFTHY)进行鉴定。确定样品CSUFTHH1、CSUFTHH2, CSUFTZJ和CSUFTHY分别为Lactarius sp.、松乳菇(Lactarius deliciosus)、橙红乳菇(Lactarius akahatsu)以及红汁乳菇(Lactarius hatsudake)。其中采集自湖南松林中的松乳菇(L. deliciosus)的形态学及分子鉴定结果属首次报道。(2)扩增得到了中国南方3个省9个不同地区的68个松乳菇的rDNA ITS序列。遗传分析发现,得到的68个松乳菇样品的ITS序列可认定为7种单倍体型,这些单倍体型聚集为2个不同的系统进化群体,表现出两种不同的系统进化方向。AMOVA测试中,观察到的总的单倍体型变异频率主要体现在不同地理种群的个体内(84%)。剩下的16%属于不同地理种群间的变异,PhiPT的显著性分析结果P<0.01。Mantel测试显示地理距离与遗传差异FST值的线性关系不显著。可见,松乳菇自然种群间有一定程度的基因漂流发生。群体遗传分析还发现在松乳菇自然种群中存在显著遗传分化,且遗传分化程度与地理距离没有显著的线性关系。(3)利用设计的多对引物成功的扩增得到松乳菇ITS、LSU以及mtSSU序列,并进行多基因谱系分析。分析结果中,多种迹象表明遗传重组在松乳菇自然种群的遗传方式中占有重要的地位。基因谱系比对分析中,3个基因位点谱系的PH测试结果除LSU与mtSSU外均支持系统发育不兼容(P<0.05)；在连锁不平衡分析中。我们分析的3个基因位点的基因片段中存在显著的随机组合迹象(P<0.001)。而且我们在松乳菇样品中也发现有明显系统发育不兼容的迹象。