目的:探讨低频重复经颅磁刺激联合盐酸帕罗西汀治疗后血清神经肽Y（Neuropeptide Y,NPY）、脑源性神经营养因子（Brain-Derived Neurotrophic Factor,BDNF）、5-羟色胺（5-hydroxytryptamine,5-HT）浓度变化与疗效的相关性。方法:纳入在2017年2月-2019年3月期间在北京回龙观医院住院的抑郁症患者共216名,其中符合入组标准的患者共110名。按照患者入院前后顺序采用随机数字表法将110名患者分配到对照组、干预组中,各入组55名。对照组采用盐酸帕罗西汀治疗方案,干预组采用在对照组基础上联合低频重复经颅磁刺激（Repetitive Transcranial Magnetic Stimulation,rTMS）治疗方案。试验期间对照组脱落10名患者,实际纳入45名,干预组脱落9名患者,实际纳入46名。为减少患者本人与评分员对抑郁症状评估差异,对患者治疗前后HAMD、PHQ-9量表评分进行一致性检验。对照组患者于早餐后口服盐酸帕罗西汀,20mg/次,根据患者病情适当调节药量至40-60mg/次,1次/d,连续服用4周。干预组患者在对照组治疗方案的基础上联合rTMS治疗,治疗时患者体位取卧位或半卧位,紧闭双眼处于安静状态5分钟,将磁刺激线圈对准左侧背外侧前额叶,线圈直径12cm,刺激频率为1Hz,10秒连续刺激,2秒间隔,刺激强度为80%的运动阈值,刺激时间共30min,共1500个脉冲,每天一次,每周5次,周末暂停2天,疗程4周,试验期间共接受20次rTMS治疗。分别用HAMD、PHQ-9量表对患者进行治疗1周后、2周后及4周后的病情评估;于治疗前、治疗4周后抽取患者6ml清晨空腹静脉血,采用酶联免疫吸附法检测血清NPY、BDNF、5-HT浓度水平,观察血清指标变化趋势,进一步探讨其与临床疗效的关系;比较两组不良反应发生率。结果:两组患者在治疗4周后痊愈率差异无统计学意义（P=0.967）;依照HAMD减分率≥50%作为临床有效的标准,两组患者有效率差异无统计学意义（P=0.173）。按照PHQ-9减分率≥40%作为有效的标准,两组患者的治疗有效率差异有统计学意义（P<0.001）;经上述两量表评估干预组的抑郁严重程度改善均优于对照组（P<0.001）;治疗1周后干预组HAMD评分显示阻滞、绝望感两项因子分改善较对照组差异有统计学意义（P<0.001）;而在治疗2周后干预组HAMD评分显示焦虑躯体化、绝望感两项因子分改善较对照组差异有统计学差异（P<0.05）;到了治疗4周后HAMD所有因子分改善较对照组差异均无统计学差异（P>0.05）;5-HT、BDNF、NPY三个指标在治疗4周后浓度较前均明显的升高,干预组升高更明显（P<0.001）;血清BDNF和5-HT浓度在治疗后的升高值依据HAMD判断与临床痊愈之间有正相关,BDNF每升高1 μg/L,患者痊愈的概率提升37%（OR=1.37）,5-HT每升高1ng/L则患者痊愈概率提升9%（OR=1.09）,相关有显著的统计学意义（P分别为0.001和0.022）;血清5-HT浓度在治疗后的升高值与依据PHQ-9判断的临床有效之间有正相关,即5-HT每升高1ng/L则患者有效的概率提升5%（OR=1.05）,相关有统计学意义（P=0.028）。两组治疗期间出现不良反应发生率差异无统计学意义（P=0.479）。结论:低频rTMS联合帕罗西汀治疗抑郁症能够早期有效改善抑郁症患者的症状,但rTMS联合帕罗西汀治疗抑郁症疗效优于帕罗西汀治疗尚不肯定;rTMS联合帕罗西汀治疗后血清5-HT、BDNF、NPY水平升高更明显;依据HAMD结果提示5-HT、BDNF浓度变化与临床治愈相关。按照PHQ-9结果提示5-HT浓度变化与临床好转相关。